Главная страница
Навигация по странице:

  • Таксономическое дерево ВИЧ

  • Ожидаемые результаты исследования

  • Распределение случаев ВИЧ-инфекции, вызванной не-А субтипами по годам

  • Предположительный путь передачи не-А субтипов установлен для 70% случаев, из них половой путь – 87%

  • Анализ парных образцов крови и цервико-вагинальные образцов (ЦВО)

  • Обнаружено 25 (1%) образцов ЦВО с определяемой вирусной нагрузкой ВИЧ при отсутствии вируса в крови

  • Анализ парных образцов крови и спинномозговой жидкости

  • вич. Тема диссертации


    Скачать 1.59 Mb.
    НазваниеТема диссертации
    Дата11.04.2022
    Размер1.59 Mb.
    Формат файлаppt
    Имя файлавич.ppt
    ТипДокументы
    #461768

    Тема диссертации


    «Генетическая и количественная оценка ВИЧ в биологических жидкостях при различном состоянии иммунной системы инфицированных пациентов»


    Научные руководители: академик РАМН Н.А.Беляков д.б.н., профессор М.Р.Бобкова


    Специальность: патологическая физиология клиническая лабораторная диагностика

    Цель исследования


    Изучить количественные и генетические особенности ВИЧ в биологических жидкостях инфицированных пациентов при различном состоянии иммунной системы для определения особенностей течения ВИЧ-инфекции

    Таксономическое дерево ВИЧ


    Географическое распределение субтипов ВИЧ

    Задачи исследования


    Оценить генетическую характеристику ВИЧ в популяции ВИЧ-инфицированных пациентов до внедрения и на фоне широкого применения ВААРТ.
    Изучить количественные и генетические особенности ВИЧ в спинномозговой жидкости и плазме у пациентов с нарушениями функций ЦНС.
    Провести сопоставление вирусной нагрузки и генетического разнообразия ВИЧ в плазме и цервикально-вагинальном содержимом у женщин с различной стадией ВИЧ-инфекции.
    Определить взаимосвязи между количественными и генетическими характеристиками ВИЧ и содержанием СD4-лимфоцитов в крови.

    Ожидаемые результаты исследования


    в процессе исследований будет определен спектр циркулирующих в Санкт-Петербурге генетических вариантов ВИЧ и изучен уровень передающейся резистентности;
    будет проведено сопоставление вирусной нагрузки в различных биологических жидкостях у пациентов с различной стадией ВИЧ-инфекции;
    в результате данной работы будут изучены генетические особенности вариантов ВИЧ, полученных из различных биологических материалов у одного и того же пациента, в том числе в динамике.

    Научная новизна


    В настоящее время мутации устойчивости и их распространенность лучше всего изучены для ВИЧ подтипа B, относительно редко встречающегося на нашей территории. Планируется изучить распространенность и спектр генетической неоднородности вариантов ВИЧ, циркулирующих в Санкт-Петербурге до и на фоне широкого применения ВААРТ.
    Впервые будут проведены репрезентативные молекулярно-биологические исследования, характеризующие генетические варианты ВИЧ в различных биологических образцах, полученных у одного пациента.
    Будет дана оценка возможности и целесообразности применения для диагностики ВИЧ-инфекции различных биологических образцов.

    Объем исследований


    Определение нуклеотидного состава гена pol ВИЧ, полученного из плазмы пациентов в 2007-2011 гг – 1200 образцов
    Изучение вирусной нагрузки ВИЧ, нуклеотидного состава гена pol и содержания CD4-клеток в образцах СМЖ и плазмы крови – 120 парных образцов
    Изучение вирусной нагрузки ВИЧ в цервикально-вагинальных мазках и плазме крови и содержания CD4-клеток в крови– 2300 парных образцов, из них 20 с определением нуклеотидного состава гена pol.

    Этапы выполнения


    2011 - 2012 гг.- изучение литературы по теме диссертации. Освоение методик, необходимых для выполнения научно-исследовательской работы. Выполнение исследований. Подготовка и публикация статей на тему диссертации, выступления на конференциях.
    2013 г.- анализ и обработка полученных результатов. Оформление и защита диссертации. Подготовка методических рекомендаций по результатам научного исследования

    Доли различных субтипов ВИЧ среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга (по результатам определения нуклеотидных последовательностей гена pol в 1104 образцах, полученных с 2006 по 2011 годы)
    Распределение случаев ВИЧ-инфекции, вызванной не-А субтипами по годам


    Среди ВИЧ-инфицированных пациентов, зарегистрированных в 2009-2011 гг на первое место вышел половой путь инфицирования (54%), доля инъекционного пути снизилась до 38% (данные по СПб, 2011)
    Предположительный путь передачи не-А субтипов установлен для 70% случаев,
    из них половой путь – 87%
    Среди пациентов, инфицированных субтипом В мужчины составляли 87%, из них
    МСМ - 56%,
    инъекционный путь - 2,5%


    Количество случаев


    год неизвестен


    Наиболее часто встречающиеся мутации лекарственной устойчивости

    Анализ парных образцов крови и цервико-вагинальные образцов (ЦВО)


    Кровь


    ЦВО


    Всего парных образцов


    2394


    Образцов с неопределяемой вирусной нагрузкой ВИЧ (количество вируса ниже чувствительности теста)


    705 (29,4%)


    1602 (66,9%)


    Диапазон вирусной нагрузки ВИЧ (lg копий/мл) в крови при неопределяемой вирусной нагрузке в ЦВО (количество вируса ниже чувствительности теста)


    0 - 5,54 (2,15)


    0


    Разница между вирусной нагрузкой ВИЧ в крови и ЦВО (lg копий/мл)


    от - 5,34 до 5,54 (1,34)


    Обнаружено 25 (1%) образцов ЦВО с определяемой вирусной нагрузкой ВИЧ при отсутствии вируса в крови


    0


    2,81 - 5,34 (3,57)


    Количество несовпадающих нуклеотидов в образцах крови и ЦВО в исследованном фрагменте pol гена (11 пар)


    6 – 32 (20)


    Коэффициент корреляции между lg вирусной нагрузки ВИЧ в крови и ЦВО


    0,63 (p<0,0001)

    Анализ парных образцов крови и спинномозговой жидкости


    Кровь


    СМЖ


    Всего парных образцов


    119


    Разница между вирусной нагрузкой ВИЧ в крови и СМЖ (lg копий/мл)


    от - 1,72 до 5,2 (1,3)


    в том числе 6% образцов с вирусной нагрузкой в СМЖ, превышающей нагрузку в крови более, чем на 0,3 lg копий/мл


    1 – 4,7


    1,8 - 5,4


    Коэффициент корреляции между lg вирусной нагрузкой ВИЧ в СМЖ и крови у "наивных" пациентов


    0,35 (p=0,0003)


    Количество несовпадающих нуклеотидов в образцах крови и СМЖ в исследованном фрагменте pol гена (75 пар)


    2 - 53 (22)


    Коэффициент корреляции между количеством несовпадающих нуклеотидов и длительностью заболевания ВИЧ-инфекцией


    0,48 (p<0,0001)


    Коэффициент корреляции между количеством несовпадающих нуклеотидов и уровнем CD4 в крови


    - 0,47 (p<0,0001)


    Спасибо за внимание



    написать администратору сайта