145_Анваров_1_13. Занятие, его номер и название

• Название: Занятие, его номер и название
• Дата: 03.04.2022
• Размер: 231.88 Kb.
• Имя файла: 145_Анваров_1_13.docx
• Тип: Занятие; #438161

Факультет	Педиатрический
Группа №	145
Фамилия, имя и отчество студента	Анваров Данил Рамилевич
Занятие, его номер и название	Статистика в диагностике: № 1 - Статистический контроль качества диагностических тестов с бинарными исходами
Номер, название и номер варианта файла с заданием:	13ГепатитВ_0.ppt
Название файла с отчетом:	145_Анваров_1_13.doc
Заполняется преподавателем
Ошибки
Оценка (максимум 2 балла)

Задание № 13: Гепатит В
Источник данных: Banks E., Reeves G., Beral V., Bull D., Crossley B., Simmond M., Hilton E., Bailey S., Barret N., Briers P., Englis R., Jackson A., Kutt E., Lavelle J., Rockal L., Wallis M.G., Wilson M., Patnick J. Influence of personal characteristics of individual women on sensitivity and specificity of mammography in the Million Women Study: cohort study // BMJ, 2004. – Vol. 329. – No. – 7464. – P. 477-479.

Таблица 2×2:



Задание 1.

1. 
   Изложите своими словами суть предложенного задания.
   

Ответ: Данные практические навыки важны в вопросах оценки качества диагностических тестов. Чувствительность и специфичность диагностического теста, а также его предсказательная способность являются базовыми понятиями, которые должен знать как научный работник, так и практикующий врач.

2. 
   Что выбрано в качестве золотого стандарта или эталона сравнения? Согласны ли Вы с его выбором?
   

Ответ: Иммуноферментный анализ(ИФА). Высокая стабильность реагентов, простота методов регистрации, возможность создания каскадных систем усиления различных химических сигналов, относительно низкая цена и многие другие достоинства метода ИФА способствовали его широкому внедрению в различные области медицины. ИФА является одним из наиболее активно развивающихся направлений химической энзимологии.

3. 
   Какой диагностический тест сравнивается с эталонным? В чем его предполагаемое преимущество перед эталонным тестом?
   

Ответ: Новый тест, при его проведении не затрачивается таких ресурсов, как при ИФА.

4. 
   Какое приложение Вы будете использовать для статистического контроля качества предлагаемого диагностического теста?
   

Ответ: DiagStatRus

5. 
   Является ли исследование одновыборочным или двух выборочным?
   

Ответ: исследование является одновыборочным

6. 
   Если исследование одновыборочное, то какую подпрограмму (название листа) Вы будете использовать?
   

Ответ: ОднаВыборка
Задание 2

Введите анализируемые данные в закрашенную область таблицы 2х2 в этой подпрограмме:

	ПОКАЗАТЕЛИ ПРЕДСКАЗАТЕЛЬНОЙ СПОСОБНОСТИ ПДТ
Предсказательность "позитивов"						Контр-предсказательность "позитивов"
		0,572	0,953	0,382				0,047	0,428		0,382		95%
PPV = P(D+|T+)	0,800	0,488	0,974	0,487	coPPV = P(D-|T+)		0,200	0,026	0,512		0,487		99%
		0,393	0,989	0,596				0,011	0,607		0,596		99,9%

1. 
   Результаты какого теста указаны в столбцах этой таблицы, а какие – в ее строках?
   

Ответ: В столбцах таблицы представляют результаты применения золотого стандарта, а в строках — результаты применения ПДТ

2. 
   Если исследование одновыборочное, то каков объем изученной выборки?
   

Ответ:328

3. 
   Сколько выявлено субъектов с болезнью?
   

Ответ: 117

4. 
   Сколько выявлено субъектов без болезни?
   

Ответ: 211

5. 
   Как принято обозначать одним словом положительные результаты проверяемого диагностического теста, и как – отрицательные результаты?
   

Ответ: Положительные результаты ПДТ принято обозначать «позитивами», а отрицательные — «негативами».

6. 
   Сколько получено позитивов и сколько негативов?
   

Ответ: позитивов-112, негативов-216

7. 
   Какими двухбуквенными символами принято обозначать истинные позитивы, ложные негативы, истинные негативы и ложные позитивы?
   

Ответ: Истинные позитивы-TP (D+T+), ложные негативы-FN (D+T-), истинные негативы-TN (D-T-), ложные позитивы-FP (D-T+)

8. 
   Сколько из них выявлено истинных позитивов, ложных негативов, истинных негативов и сколько ложных позитивов?
   

Ответ: Выявлено истинных позитивов-112, ложных негативов-5, истинных негативов-211, ложных позитивов-0

Задание 3

СТАТИСТИЧЕСКИЕ ОЦЕНКИ ВЕРОЯТНОСТНЫХ ПОКАЗАТЕЛЕЙ РАСПОЗНАВАТЕЛЬНОЙ СПОСОБНОСТИ ПДТ

1. 
   Какие вероятностные показатели распознавательной способности Вы будете оценивать? Сколько таких показателей? Перечислите их названия, символьные обозначения и формульные выражения. Изложите своими словами их смысл.
   

Ответ:Чувствительность(Se-способность теста распознавать больных=a+1/a+c+2),контр-чувствительность(coSe=1-Se),специфичность(Sp-способность теста распознавать здоровых=d+1/b+d+2), контр-специфичность (coSp=1-Sp)

		Границы ДИ						Границы ДИ						Уровень
Показатель	Оценка	Нижняя	Верхняя	Ширина ДИ		Показатель	Оценка	Нижняя		Верхняя		Ширина ДИ		доверия
	ПОКАЗАТЕЛИ РАСПОЗНАВАТЕЛЬНОЙ СПОСОБНОСТИ ПДТ
Чувствительность ПДТ					Контр-специфичность ПДТ
		0,361	0,769	0,409				0,0667		0,5561		0,4894		95%
Se = P(T+|D+)	0,571	0,299	0,819	0,520		coSp = P(T+|D-)	0,2727	0,0370		0,6482		0,6112		99%
		0,234	0,868	0,634				0,0166		0,7437		0,7271		99,9%
		Неинформативное значение: 0,5
Контр-чувствительность ПДТ					Специфичность ПДТ
		0,231	0,639	0,409				0,4439		0,9333		0,4894		95%
coSe = P(T-|D+)	0,429	0,181	0,701	0,520		Sp = P(T-|D-)	0,7273	0,3518		0,9630		0,6112		99%
		0,132	0,766	0,634				0,2563		0,9834		0,7271		99,9%

2. 
   Скопируйте блок с полученными результатами для показателей распознавательной способности в нижеследующую таблицу.
   

3. 
   Какие значения показателей распознавательной способности ПДТ следует признать неинформативными? Введите неинформативное значение для этих показателей в соответствующую строку в этой таблице.
   

4. 
   Является ли отклонение каждого из оцениваемых показателей распознавательной способности ПДТ от их неинфоромативных значений статистически значимым или нет? Изложите ход рассуждений об их статистической значимости. (Что означает, когда ДИ содержит неинформативное значение данного показателя? Что означает, когда ДИ не содержит неинформативное значение данного показателя?
   

Ответ: Доверительный интервал 95%(99%,99,9%) не покрывает неинформативное значение, значит, оцениваемое значение отличается от неинформативного.

5. 
   Используя вербальную шкалу, охарактеризуйте словесно практическую ценность полученных оценок показателей распознавательной способности ПДТ.
   

Ответ: Чувствительность позитивов к наличию болезней = 0,571 , чувствительная способность негативов ниже, и равна 0,35. Это значит, что тест обладает распознавательной способностью к определению наличия болезни большей, чем для определения отсутствия болезни.

СТАТИСТИЧЕСКИЕ ОЦЕНКИ ВЕРОЯТНОСТНЫХ ПОКАЗАТЕЛЕЙ ПРЕДСКАЗАТЕЛЬНОЙ СПОСОБНОСТИ ПДТ

1. 
   Какие вероятностные показатели предсказательной способности Вы будете оценивать? Сколько таких показателей? Перечислите их названия, символьные обозначения и формульные выражения. Изложите словами их смысл.
   

Ответ: PPV-предсказательная способность позитива(=P(D+/T+)) определяет способность теста правильно прогнозировать болезнь. NPV-предсказательная способность негатива (=P(D-/T-)) определяет способность диагностировать отсутствие болезни.

2. 
   Перепишите или скопируйте блок с полученными результатами для показателей предсказательной способности в нижеследующую таблицу.
   

	ПОКАЗАТЕЛИ ПРЕДСКАЗАТЕЛЬНОЙ СПОСОБНОСТИ ПДТ
Предсказательность "позитивов"					Контр-предсказательность "позитивов"
		0,572	0,953	0,382				0,047		0,428		0,382		95%
PPV = P(D+|T+)	0,800	0,488	0,974	0,487		coPPV = P(D-|T+)	0,200	0,026		0,512		0,487		99%
		0,393	0,989	0,596				0,011		0,607		0,596		99,9%
Контр-предсказательность "негативов"					Предсказательность "негативов"
		0,29878	0,75349	0,45471				0,24651		0,7012		0,4547		95%
coNPV = P(D+|T-)	0,52941	0,23623	0,81031	0,51154		NPV = P(D-|T-)	0,4706	0,18969		0,7638		0,5741		99%
		0,17348	0,86554	0,69206				0,13446		0,8265		0,6921		99,9%
Распространенность заболевания					Контр-распространенность заболевания
		0,4917	0,8206	0,3289				0,1794		0,5083		0,3289		95%
Prev = P(D+)	0,6667	0,4349	0,8580	0,4231		coPrev = P(D-)	0,3333	0,1420		0,5651		0,4231		99%
		0,3712	0,8948	0,5237				0,1052		0,6288		0,5237		99,9%

Сравните интервальные оценки для параметров предсказательной способности ПДТ c интервальными оценками распространенности и контр-распространенности заболевания.
Ответ:При 99,9% ДИ для PPV не пересекается с 99,9% ДИ для Prev, следовательно, оцениваемое значение PPV статистически отличается от распространенности на незначительном уровне.

Изложите ход рассуждений о статистической значимости их различий:

Что означает, когда ДИ для предсказательности позитивов перекрываются с ДИ для распространенности?

Ответ: Это означает, что оцениваемое значение PPV статистически не отличается от распространенности, то есть тест неинформативен.

Что означает, когда ДИ для предсказательности позитивов не перекрываются с ДИ для распространенности?

Ответ: Это означает, что оцениваемое значение PPV статистически отличается от распространенности, то есть тест эффективен.
Что означает, когда ДИ для предсказательности негативов перекрываются с ДИ для контр-распространенности?

Ответ: Это означает, что оцениваемое значение NPV статистически не отличается от контр-распространенности, то есть тест неинформативен.
Что означает, когда ДИ для предсказательности негативов не перекрываются с ДИ для контр-распространенности?

Ответ: Это означает, что оцениваемое значение NPV статистически отличается от контр-распространенности, то есть тест эффективен.
Какие значения показателей предсказательной способности ПДТ следует признать неинформативными?

Ответ:0,5 и ниже
Введите неинформативное значение для этих показателей в соответствующую строку в этой таблице.

Ответ: 0,5
Является ли отклонение каждого из оцениваемых показателей предсказательной способности ПДТ от их неинфоромативных значений статистически значимым или нет?

Ответ: да
Изложите ход рассуждений об их статистической значимости:

Что означает, когда ДИ содержит неинформативное значение данного показателя?

Ответ: Оцениваемое значение не отличается
Что означает, когда ДИ не содержит неинформативное значение данного показателя?

Ответ: значение отличается
Используя вербальную шкалу, охарактеризуйте словесно практическую ценность полученных оценок показателей предсказательной способности ПДТ.

Ответ: Предсказательная способность позитивов низкая, негативов-высокая.

СТАТИСТИЧЕСКИЕ ОЦЕНКИ ОТНОШЕНИЙ ПРАВДОПОДОБИЙ И ИХ ИНВЕРСИЙ

1. 
   Перепишите или скопируйте блок с полученными результатами для отношений правдоподобий и их инверсий в нижеследующую таблицу.
   

		ОТНОШЕНИЯ ПРАВДОПОДОБИЙ И ИХ ИНВЕРСИИ
Отношение правдоподобий для "позитивов"					Инверсия отношения правдоподобий для "позитивов"
		0,89	8,725	7,8				0,1146		1,1237		1,0091		95%
LR[+] = P(T+|D+) / P(T+|D-)	2,1	0,70	15,67	15,0	invLR[+] = 1 / LR[+]	0,477		0,0638		1,4208		1,3570		99%
		0,54	34,79	34,2				0,0287		1,8399		1,8112		99,9%
		Неинформативное значение: 1
Инверсия отношения правдоподобий для "негативов"					Отношение правдоподобий для "негативов"
		0,30	1,110	0,81				0,90		3,29		2,4		95%
invLR[-] = 1 / LR[-]	0,589	0,24	1,406	1,17	LR[-] = P(T-|D-) / P(T-|D+)	1,7		0,71		4,17		3,5		99%
		0,17	1,910	1,73				0,52		5,68		5,2		99,9%

2. 
   Изложите своими словами суть таких показателей как отношения правдоподобий в терминах распознавательной способности ПДТ и в терминах оддов (шансов за/против). В частности, как вы понимаете, что такое одды?
   

Ответ: Отношение правдоподобий для позитивов LR+ показывает во сколько раз шансов наличия болезни больше против ее отсутствия. Отношение правдоподобий для негативов LR- показывает во сколько раз шансов отсутствия болезни больше против ее наличия.

3. 
   Какие значения отношений правдоподобий следует признать неинформативными? Введите неинформативное значение для этих показателей в соответствующую строку в этой таблице. Ответ: 1
   
4. 
   Является ли отклонение каждого из оцениваемых отношений правдоподобий от их неинфоромативных значений статистически значимым или нет? Изложите ход рассуждений об их статистической значимости (Что означает, когда ДИ содержит неинформативное значение данного показателя? Что означает, когда ДИ не содержит неинформативное значение данного показателя?)
   

Ответ: Отношение правдоподобий для "позитивов" является статически значимо больше неинформативного значения 1 на уровне значимости 0,05; 0,01 и 0,001, поскольку нижняя граница д.и. 95%, 99% и 99,9% больше, чем 1.

5. 
   Используя вербальную шкалу, охарактеризуйте словесно практическую ценность полученных оценок отношений правдоподобий.
   

Ответ: Повышение послетестовых шансов за/против наличия болезни у субъекта с позитивом по сравнению с претестовыми шансами за/против наличия у него болезни малое.

ГРАФИК ПРЕДСКАЗАТЕЛЬНОСТЕЙ

1. 
   Какую подпрограмму Вы будете использовать для графического представления полученных результатов?
   

2. 
   Постройте график предсказательностей, скопируйте его в отчет и сопоставьте его с прилагаемым шаблоном.
   

3. 
   На основе полученных графиков предсказательностей изложите свое мнение о качестве проверяемого диагностического теста. При этом обратите внимание на ширину доверительных интервалов (доверительных зон) на этих графиках и сформулируйте выводы о точности оценок предсказательности позитивов и предсказательности негативов.