Нуклеозиды. Нуклеотиды. Нуклеиновые кислоты план Нуклеиновые основания
 Скачать 414.61 Kb.
|
|
НУКЛЕОЗИДЫ. НУКЛЕОТИДЫ. НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ План 1. Нуклеиновые основания. 2. Нуклеозиды. 3. Нуклеотиды. 4. Нуклеотидные коферменты. 5. Нуклеиновые кислоты. Нуклеиновые кислоты – присутствующие в клетках всех живых организмов биополимеры, которые выполняют важнейшие функции по хранению и передаче генетической информации и участвуют в механизмах ее реализации в процессе синтеза клеточных белков. Установление состава нуклеиновых кислот путем их последовательного гидролитического расщепления позволяет выделить следующие структурные компоненты. Рассмотрим структурные компоненты нуклеиновых кислот в порядке усложнения их строения. 1. Нуклеиновые основания Гетероциклические основания, входящие в состав нуклеиновых кислот (нуклеиновые основания, - это гидрокси- и аминопроизводные пиримидина и пурина. Нуклеиновые кислоты содержат три гетероциклических основания с пиримидиновым циклом (пиримидиновые основания) и два - с пуриновым циклом пуриновые основания. Нуклеиновые основания имеют тривиальные названия и соответствующие однобуквенные обозначения. В составе нуклеиновых кислот гетероциклические основания находятся в термодинамически стабильной оксоформе. Кроме этих групп нуклеиновых оснований, называемых основными, в нуклеиновых кислотах в небольших количествах встречаются минорные основания 6-оксопурин (гипоксантин), 3-N-метилурацил, 1-N-метилгуанин и др. Нуклеиновые кислоты включают остатки моносахаридов – рибозы и 2- дезоксирибозы. Оба моносахарида присутствуют в нуклеиновых кислотах в -фуранозной форме. 2. Нуклеозиды. 3. Нуклеозиды – это гликозиды, образованные нуклеиновыми основаниями и рибозой или дезоксирибозой. Между аномерным атомом углерода моносахарида и атомом азота в положении 1 пиримидинового цикла или атомом азота в положении 9 пуринового цикла образуется - гликозидная связь. В зависимости от природы моносахаридного остатка нуклеозиды делят на рибонуклеозиды (содержат остаток рибозы) и дезоксирибонуклеозиды содержат остаток дезоксирибозы. Названия нуклеозидов строят на основе тривиальных названий нуклеиновых оснований, добавляя окончание –идин для производных пиримидина и -озин для производных пурина. К названиям дезоксирибонуклеозидов добавляют приставку дезокси-. Исключение составляет нуклеозид, образованный тимином и дезоксирибозой, к которому приставка дезокси- не добавляется, так как тимин образует нуклеозиды с рибозой лишь в очень редких случаях. Для обозначения нуклеозидов используются однобуквенные обозначения, входящих в их состав нуклеиновых оснований. К обозначениям дезоксирибонуклеозидов ( за исключением тимидина) добавляется буква д. Наряду с представленными на схеме основными нуклеозидами в составе нуклеиновых кислот встречаются минорные нуклеозиды, содержащие модифицированные нуклеиновые основания (см. выше. В природе нуклеозиды встречаются также в свободном состоянии, преимущественно в виде нуклеозидных антибиотиков, которые проявляют противоопухолевую активность. Нуклеозиды-антибиотики имеют некоторые отличия от обычных нуклеозидов в строении либо углеводной части, либо гетероциклического основания, что позволяет им выступать в качестве антиметаболитов, чем и объясняется их антибиотическая активность. Как гликозиды, нуклеозиды устойчивы к действию щелочей, но расщепляются под действием кислот с образованием свободного моносахарида и нуклеинового основания. Пуриновые нуклеозиды гидролизуются значительно легче пиримидиновых. 3. Нуклеотиды Нуклеотиды – это эфиры нуклеозидов и фосфорной кислоты (нуклеозидфосфаты). Сложноэфирную связь с фосфорной кислотой образует ОН группа в положении 5 / или 3 / моносахарида. В зависимости от природы моносахаридного остатка нуклеотиды делят на рибонуклеотиды структурные элементы РНК) и дезоксирибонуклеотиды (структурные элементы ДНК. Названия нуклеотидов включают название нуклеозида с указанием положения в нем остатка фосфорной кислоты. Сокращенные обзначения нуклеозидов содержат обозначение нуклеозида, остатка моно-, ди- или трифосфорной кислоты, для производных указывается также положение фосфатной группы. Нуклеотиды являются мономерными звеньями, из которых построены полимерные цепи нуклеиновых кислот. Некоторые нуклеотиды выполняют роль коферментов и участвуют в обмене веществ. 4. Нуклеотидные коферменты Коферменты – это органические соединения небелковой природы, которые необходимы для осуществления каталитического действия ферментов. Коферменты относятся к разным классам органических соединений. Важную группу коферментов составляют нуклеозидполифосфаты. Аденозинфосфаты – производные аденозина, содержащие остатки монодии трифосфорных кислот. Особое место занимают аденозин-5 / -моно-, ди- и трифосфаты - АМФ, АДФ и АТФ - макроэргические вещества, которые обладают большими запасами свободной энергии в подвижной форме. Молекула АТФ содержит макроэргические связи РО, которые легко расщепляются в результате гидролиза. Выделяющаяся при этом свободная энергия обеспечивает протекание сопряженных с гидролизом АТФ термодинамически невыгодных анаболических процессов, например, биосинтез белка. Кофермент А. Молекула этого кофермента состоит из трех структурных компонентов пантотеновой кислоты, 2-аминоэтантиола и АДФ. Кофермент А участвует в процессах ферментативного ацилирования, активируя карбоновые кислоты путем превращения их в реакционноспособные сложные эфиры тиолов. Никотинамидадениндинуклеотидные коферменты. Никотинамидадениндинуклеотид НАД) и его фосфат (НАДФ + ) содержат в своем составе катион пиридиния в виде никотинамидного фрагмента. Пиридиниевый катион в составе этих коферментов способен обратимо присоединять гидрид-анион с образованием восстановленной формы кофермента - НАД Н. Таким образом никотинамидадениндинуклеотидные коферменты участвуют в окислительно-восстановительных процессах, связанных с переносом гидрид- аниона, например, окислении спиртовых групп в альдегидные (превращение ретинола в ретиналь, восстановительном аминировании кетокислот, восстановлении кетокислот в гидроксикислоты. Входе этих процессов субстрат теряет (окисление) или присоединяет (восстановление) два атома водорода в виде Ни Н. Кофермент служит при этом акцептором (НАД) или донором (НАД . Н) гидрид-иона. Все процессы с участием коферментов являются стереоселективными. Так, при восстановлении пировиноградной кислоты образуется исключительно молочная кислота. 5. Нуклеиновые кислоты Первичная структурануклеиновых кислот представляет собой линейную полимерную цепь, построенную из мономеров – нуклеотидов, которые связаны между собой 3 / -5 / - фосфодиэфирными связями. Полинуклеотидная цепь имеет конец и 3'- конец. На конце находится остаток фосфорной кислоты, а на 3'- конце - свободная гидроксильная группа. Нуклеотидную цепь принято записывать, начиная с конца. В зависимости от природы моносахаридных остатков в нуклеотиде различают дезоксирибонуклеиновые кислоты (ДНК) и рибонуклеиновые кислоты (РНК. ДНК и РНК различаются также по природе входящих в их состав нуклеиновых оснований урацил входит только в состав РНК, тимин – только в состав ДНК. РНК ДНК Урацил Тимин Цитозин, аденин, гуанин Цитозин, аденин, гуанин Вторичная структура ДНК представляет собой комплекс двух полинуклеотидных цепей, закрученных вправо вокруг общей оси так, что углевод-фосфатные цепи находятся снаружи, а нуклеиновые основания направлены внутрь (двойная спираль Уотсона-Крика). Шаг спирали - 3.4 нм, на 1 виток приходится 10 пар нуклеотидов. Полинуклеотидные цепи антипараллельны, т.е. напротив конца одной цепи находится конец другой цепи. Две цепи ДНК неодинаковы по своему составу, но они комплементарны. Это выражается в том, что напротив аденина (А) водной цепи всегда находится тимин (Т) в другой цепи, а напротив гуанина (Г) всегда находится цитозин Ц. Комплементарное спаривание Ас Т и Гс Ц осуществляется за счет водородных связей. Между Аи Т образуется две водородные связи, между Г и Ц – три. Комплементарность цепей ДНК составляет химическую основу важнейшей функции ДНК – хранения и передачи генетической информации. Типы РНК Известны три основных вида клеточных РНК транспортные РНК (тРНК), матричные РНК (мРНК) и рибосомные РНК (рРНК). Они различаются по месторасположению в клетке, составу и размерами, а также функциями. РНК состоят, как правило, из одной полинуклеотидной цепи, которая в пространстве складывается таким образом, что ее отдельные участки становятся комплементарными друг другу (слипаются) и образуют короткие двуспиральные участки молекулы, в то время как другие участки остаются однотяжевыми. Матричные РНК выполняют функцию матрицы белкового синтеза в рибосомах. Рибосомные РНК выполняют роль структурных компонентов рибосом. Транспортные РНК участвуют в транспортировке -аминокислот из цитоплазмы в рибосомы ив переводе информации нуклеотидной последовательности мРНК в последовательность аминокислот в белках. Механизм передачи генетической информации. Генетическая информация закодированиа в нуклеотидной последовательности ДНК. Механизм передачи этой информации включает три основных этапа. Первый этап – репликация копирование материнской ДНК с образованием двух дочерних молекул ДНК, нуклеотидная последовательность которых комплементарна последовательности материнской ДНК и однозначно определяется ею. Репликация осуществляется путем синтеза новой молекулы ДНК на материнской, которая играет роль матрицы. Двойная спираль материнской ДНК раскручивается и на каждой из двух цепей происходит синтез новой (дочерней) цепи ДНК с учетом принципа комплементарности. Процесс осуществляется под действием фермента ДНК-полимеразы. Таким образом из одной материнской ДНК образуются две дочерних, каждая из которых содержит в своем составе одну материнскую и одну вновь синтезированную полинуклеотидную цепь. Второй этап – транскрипция – процесс, входе которого часть генетической информации переписывается с ДНК в форме мРНК. Матричная РНК синтезируется на участке деспирализованной цепи ДНК как на матрице под действием фермента РНК-полимеразы. В полинуклеотидной цепи мРНК рибонуклеотиды, несущие определенные нуклеиновые основания, выстраиваются в последовательности, определяемой комплементарными взаимодействиями с нуклеиновыми основаниями цепи ДНК. При этом адениновому основанию в ДНК будет соответствовать урациловое основание в РНК. Генетическая информация о синтезе белка закодирована в ДНК с помощью триплетного кода. Одна аминокислота кодируется последовательностью из трех нуклеотидов, которую называют кодоном. Участок ДНК, кодирующий одну полипептидную цепь, называется геном. Каждому кодону ДНК соответствует комплементарный кодон в мРНК. В целом молекула мРНК комплементарна определенной части цепи ДНК – гену. Процессы репликации и транскрипции происходят в ядре клетки. Синтез белка осуществляется в рибосомах. Синтезированная мРНК мигрирует из ядра в цитоплазму к рибосомам, перенося генетическую информацию к месту синтеза белка. Третий этап – трансляция – процесс реализации генетической информации, которую несет мРНК в виде последовательности нуклеотидов в последовательность аминокислот в синтезируемом белке. -Аминокислоты, необходимые для синтеза белка транспортируются к рибосомам посредством тРНК, с которыми они связываются путем ацилирования ОН группы на конце цепи тРНК. тРНК имеет антикодоновую ветвь, содержащую тринуклеотид - антикодон, который соответствует переносимой ею аминокислоте. На рибосоме тРНК прикрепляются антикодоновыми участками к соответствующим кодонам мРНК. Специфичность стыковки кодона и антикодона обеспечивается их комплементарностью. Между сближенными аминокислотами образуется пептидная связь. Таким образом реализуется строго определенная последовательность соединения аминокислот в белки, закодированная в генах. |