биология. 1. Свойства жизни и уровни организации живых систем. Клетка как элементарная структурная и функциональная единица живого. Основные положения клеточной теории
 Скачать 157.87 Kb.
|
|
8.Генетический код, его структура и свойства. Генетический код- система записи информации о последовательности аминокислот в пептиде в виде последовательности нуклеотидов в ДНК. В многообразии белков , существующих в природе, было обнаружено около 20 различных аминокислот. Для их шифровки достаточное количество сочетаний нуклеотидов может обеспечить лишь триплетный код, в котором каждая аминокислота шифруется тремя стоящими рядом нуклеотидами. Из четырех нуклеотидов ,образуется 43 =64 триплета. Из 64 возможных триплетов Днк кодирует 61, остальные получили названия «нонсенс-триплетов». Они не шифруют аминокислот , выполняют функцию знаков препинания при считывании наследственной информации. (АТТ, АЦТ, АТЦ) Последовательность кодонов в гене определяет последовательность аминокислот в полипептидной цепи белка, кодируемого этим геном. Кодон – это определенное сочетание трех нуклеотидов, кодирующее конкретную аминокислоту Свойства: Специфичность - Каждый кодон кодирует одну АК Вырожденность - Каждая АК закодирована двумя и более кодонами. Исключения: метионин (в ДНК —ТАЦ, в РНК - АУГ) и триптофан (в ДНК -АЦЦ, в РНК - УГГ) Непрерывность - Считывание генетической информации с иРНК — всегда по три нуклеотида от 5'- к3'-концу Универсальность - У всех живых существ принцип кодирования АК един. Исключения ряд кодонов ДНК митохондрий Неперекрываемость - Нуклеотид соседних кодонов входит в состав только одного кодона («внутри гена нет гена»). Исключения: гены многих вирусов, ряд генов человека (матуразы,цитохрома Ь и др.) Кодон-инициатор ТАЦ (АУГ) кодирует метионин, определяет начало трансляции Кодоны-терминаторы АТТ (УАА), АЦТ (УГА), АТЦ (УАГ)определяют окончание трансляции. Исключение: генетический код митохондрий 9. Реализация генетической информации в клетке . Основные этапы экспрессии гена эукариот,их сущность. Этапы: 1. Претранскрипционный - Активация гена 2. Транскрипция Синтез про— иРНК (гяРНК гетерогенная ядерная РНК) на матрице ДНК 3. Процессинг-сплайсинг- Созревание иРНК: кэпирование (на 5'-конце); полиаденилирование (на З'-конце); вырезание интронов и сшивание экзонов. 4. Транспорт иРНК через оболочку ядра -Селективный отбор иРНК (транспортируются 5% иРНК, остальные расщепляются) 5. Трансляция- Синтез полипептида на матрице иРНК 6. Посттрансляционный -Процессинг (созревание) белка (формирование функционально активного белка) Транскрипция слагается из трех основных этапов: инициация, элонгация и терминация. Инициация: РНК-полимераза «узнает» свой промотор и присоединяется к нему. Элонгация: РНК-полимераза движется по одной из цепей ДНК (гена) и синтезирует иРНК. Терминация — окончание транскрипции. Транскрипция — синтез РНК с использованием ДНК в качестве матрицы. В результате возникает 3 типа РНК: - матричная (мРНК); - рибосомная (рРНК); - транспортная (тРНК). Процесс транскрипции требует больших затрат энергии в виде АТФ и осуществляется ферментом ДНК-зави-симой-РНК-полимеразой трех типов и рядом так называемых вспомогательных факторов. Одномоментно транскрибируется не вся молекула ДНК, а лишь отдельные ее отрезки. Они называются единицами транскрипции, или транскриптонами. По сути транскриптон — это и есть ген с точки зрения молекулярной биологии. Напомним, что промотор — участок ДНК длиной в несколько десятков нуклеотидов, куда присоединяется РНК-полимераза и откуда начинается транскрипция. Терминатор — участок ДНК, содержащий сигнал (последовательность) окончания транскрипции. Поскольку у бактерий оперонная организация генома, у них транскрибируются сразу несколько генов, объединенных одной функцией. У эукариот за один раз транскрибируется только один ген. Транскрипция, как и репликация ДНК, основана на способности азотистых оснований нуклеотидов к комплементарному связыванию. Аналогично репликации, при транскрипции полимераза (здесь уже РНК-полимераза) шаг за шагом подбирает и “сшивает” нуклеотиды комплементарные матричной последовательности. Отличительной особенностью транскрипции является то, что в РНК нет тимидина, его замещает уридин; соответственно при транскрипции аденозин молекулы ДНК спаривается с уридином синтезируемой РНК. На время транскрипции двойная цепь ДНК разрывается и синтез РНК осуществляется по одной цепи ДНК, которая называется кодирующей. Вторая цепь является некодирующей. Какая цепь будет кодирующей, определяется тем, на какой из них находится промотор. В процессе транскрипции образуется гибрид одноцепочечной ДНК с РНК, который существует короткое время и очень быстро распадается, при этом восстанавливается нативная двуцепочечность ДНК. Цикл транскрипции состоит из трех стадий: - инициации; - элонгации; - терминации. Им предшествует узнавание промотора или подготовительная стадия, на которой РНК-полимераза узнает промотор и связывается с ним. Одновременно происходит локальное расплетение ДНК примерно на 10 пар нуклеотидов. 1 Инициация. На этой стадии происходит образование нескольких начальных звеньев РНК (так называемый синтез критической длины). До этого комплекс полимераза-ДНК не стабилен и способен распадаться. 2. Элонгация. Продолжается дальнейшее расплетение ДНК и синтез РНК по кодирующей цепи. Он, равно как и синтез ДНК, осуществляется в направлении 5- 3. 3. Терминация. Как только полимераза достигает терминатора, она немедленно отщепляется от ДНК, локальный гибрид ДНК-РНК разрушается и новосинтезированная РНК транспортируется из ядра в цитоплазму. На этом транскрипция заканчивается. Созревание РНК Все образовавшиеся РНК непосредственно после трансляции не способны, функционировать, так как они синтезируются в виде молекул-предшественников: пре-р, пре-т и пре-м РНК. Чтобы начать работать, пре-РНК должны подвергнуться процессингу (созреванию). Под процессингом понимают совокупность биохимических реакций, при которых пре-РНК укорачиваются, подвергаются химическим модификациям, в результате которых образуются зрелые РНК. Процессинг т- и рРНК осуществляется по одинаковому плану. В основном вырезаются лишние фрагменты с 3'- и 5'-концов и химически модифицируются азотистые основания. Процессинг мРНК гораздо сложнее. Интересно, что мРНК прокариот (бактерий) процессингу не подвергаются вообще — это единственные РНК, способные работать сразу после синтеза. У эукариот Процессинг мРНК осуществляется многоступенчато и включает модификацию 3'- и 5'- концов, а также вырезание интронов. В последнем процессе участвует четвертый известный тип РНК — малая ядерная РНК (мяРНК). которая удерживает концы, экзонов при вырезании интронов. Трансляция — синтез полипептидной цепи с использованием мРНК в роли матрицы. Как и транскрипция, трансляция — сложный многостадийный процесс, требующий значительных затрат энергии и участия большого числа (до 300) вспомогательных молекул. В трансляции участвуют все три основных типа РНК: м-, р- и тРНК. мРНК является информационной матрицей; тРНК “подносят” аминокислоты и узнают кодоны мРНК; рРНК вместе с белками образуют рибосомы, которые удерживают мРНК, тРНК и белок и осуществляют синтез полипептидной цепи. Процесс трансляции основывается на том, что каждому триплету мРНК (кодону) соответствует определенная аминокислота. Генетический код расшифровывают (реализуют) тРНК. Напомним, что тРНК имеет структуру, состоящую из четырех петель. К одной из них присоединяется аминокислота (акцепторная петля), в противоположной (антикодоновой) находится триплет нуклеоти-дов, комплементарный кодону мРНК. Этот триплет называют антикодоном. Так, аминокислоте триптофану соответствует кодон УГГ в мРНК, триптофановая тРНК имеет антикодон АЦЦ. Транскрипция состоит из подготовительного и трех основных этапов. Подготовительный этап. На этом этапе происходит образование аминоацил-тРНК — присоединение аминокислоты к соответствующей тРНК. Эти реакции протекают в цитоплазме и осуществляются ферментами ами-ноацил-тРНК-синтетазами. Именно эти ферменты контролируют соответствие аминокислоты типу тРНК (ее антикодону). 1. Инициация. Происходит образование цельной рибосомы, присоединение мРНК и установление первой аминокислоты. Напомним, что каждая рибосома состоит из двух субъединиц — малой и большой. В нерабочем состоянии они обычно не связаны друг с другом (говорят, что рибосома диссоциирована). В процессе же трансляции рибосомы находятся в “собранном” состоянии. В цельной рибосоме выделяют участок присоединения тРНК, “нагруженной” аминокислотой (то есть аминоацил-тРНК) — акцепторный (А-сайт) и участок удержания тРНК с растущей полипептидной цепью — пептидильный (Р-сайт) (в молекулярной биологии выражение “участок цепи” часто заменяют термином “сайт”). Непосредственной связи между мРНК и растущей белковой цепью нет — она осуществляется через тРНК. Во время инициации (при участии трех вспомогательных белковых факторов) происходит связывание мРНК с малой субъединицей рибосомы, затем к первому кодону своим антикодоном присоединяется “груженая” (несущая аминокислоту) тРНК, а после этого к образовавшемуся комплексу присоединяется большая субъединица рибосомы. Интересно, что первой аминокислотой всех белков у эукариотических организмов всегда является метионин, а у прокариот — формил-метионин. 2. Элонгация. Ко второму кодону (в А-сайт рибосомы) присоединяется еще одна аминоацил-тРНК. Между карбоксильной группой (-СООН) первой аминокислоты и аминогруппой (-NH,) второй образуется пеп-тидная связь. После этого первая аминокислота отсоединяется от своей тРНК и “повисает” на соединенной с ней аминокислоте второй тРНК. Пустая первая тРНК освобождается из комплекса с рибосо-мой, и Р-сайт становится незанятым. Рибосома “делает шаг” вдоль мРНК. При этом тРНК с аминокислотами перемещается из А-сайта в Р-сайт. “Шаг” рибосомы всегда строго определен и равен трем нук-леотидам (кодону). Движение рибосомы вдоль мРНК называется транслокацией. Как репликация и транскрипция, транслокация всегда осуществляется в 5' — 3' направлении мРНК. 3. Терминация. Синтез полипептидной цепи идет до тех пор, пока рибосома не достигнет одного из трех стоп-кодонов. В этот момент белковая цепь отделяется, а рибосома диссоциирует на субъединицы. Практически все белки по окончании своего синтеза подвергаются созреванию или процессингу — реакциям посттрансляционных модификаций. После этого они (в основном по “трубопроводу” эндоплазматической сети) транспортируются к месту своего назначения. Характерно, что мРНК транслируется не одной, а одновременно несколькими (до 80) рибосомами. Такие группы рибосом, осуществляющие синтез белка на одной молекуле мРНК, называют полисомами. В результате этого резко увеличивается “производительность” трансляции в единицу времени. 10. Хромосома, ее химический состав. Уровни упаковки ДНП в хромосоме. Хромосома состоит из Днк(40%) и белков(60%), которые образуют нуклеопротеиновый комплекс – хроматин. Белки(гистоны)составляют значительную часть вещества хромосом. По мимо Днк и белков так же имеются РНК, липиды, полисахариды, ионы металлов. Уровни упаковки: Нуклеосомный- ДНК + белки-гистоны Н2А, Н2В, НЗ, Н4. Четыре класса гистоновых белков формируют ядро нуклеус вокруг которого ДНК делает 1.5 оборота- около 140 нуклеотидных пар, (между нуклеосомами 50-70 нуклеотидных пар) Днк укорачивается в 6-7 раз. Фибриллярный- Нуклеосомная нить + белок(гистон HI). При образовании фибриллы нуклеосомы сближаются за счет разности зарядов «хвоста» гистона НI и фосфатной группы ДНК. ДНК укорачивается в 42 раза. Интерфазные хромосомы- Хроматиновая фибрилла с помощью негистоновых белков укладывается в петли. Хромосомы максимально деконденсированы,1 молекула ДНК, функционально активна ,не видны в световой микроскоп. Видны глыбки хроматина. ДНК укорачивается в в 1600 раз Метафазные хромосомы- Суперконденсация хроматина. Максимально конденсированы,2 хроматиды, функционально не активны, видны в световой микроскоп. ДНК укорачивается в В 8000 раз. В зависимости от компактизации хроматина в интерфазный период в хромосоме различают эухроматин и гетерохроматин. Эухроматин в интерфазе деконденсирован, слабо окрашивается, генетически активен, реплицируется в начале S-периода, содер¬жит уникальные и умеренные повторы нуклеотидов. Гетерохроматин всегда конденсирован, интенсивно окрашивается, генетически неактивен, реплицируется в конце S-периода, содержит часто повторяющиеся последовательности нуклеотидов. Гетеро¬хроматин чаще всего располагается в прицентромерных, иногда - в прителомерных областях, но вкрапления гетерохроматина есть и в эухроматиновых участках. 11.Кариотип.Идиограмма. Морфология хромосом. Методы идентификации хромосом
|