Примерные задачи к экзамену по Биохимии для студентов 2 курса специальности Лечебное дело
Скачать 5.35 Mb.
|
Примерные задачи к экзамену по Биохимии для студентов 2 курса специальности «Лечебное дело» 2015-2016 учебный год Задача 1. Фермент уреаза при рН 8,0 и 20оС ускоряет гидролиз мочевины в 1014 раз. Если заданное количество мочевины может полностью прогидролизовать заданное количество уреазы при рН 8,0 и 20оС за 5 мин, сколько времени потребовалось бы для гидролиза того же количества мочевины в тех же условиях, но без фермента? Предполагается, что обе реакции происходят в стерильных условиях без доступа бактерий. 9,5*10^8 лет Задача 2. Простагландины – это класс эйкозаноидов, т.е. производных жирных кислот, оказывающих чрезвычайно сильное влияние на ткани позвоночных животных. Простагландины (ПГ) связаны с возникновением лихорадки и воспаления, а также сопутствующими им болевыми ощущениями. Простагландины образуются из 20-углеродной жирной кислоты, называемой арахидоновой кислотой, в результате реакции, которую катализирует фермент простагландин-эндопероксид-синтаза. Этот фермент из класса циклооксигеназ использует кислород для превращения арахидоновой кислоты в ПГ G2, являющийся непосредственным предшественником многих различных простагландинов. В таблице представлены кинетические данные для реакции, катализируемой простагландин-эндопероксид-синтазой. Ибупрофен является ингибитором простагландин-эндопероксид-синтазы. Путем ингибирования синтеза ПГ ибупрофен снижает воспаление и боль. Постройте график зависимости скорости ферментативной реакции от концентрации субстрата в двойных обратных координатах (координаты Лайнуивера-Берка) в отсутствии и присутствии ингибитора (ибупрофена). Определите кинетические параметры Vmax и Km для данного фермента. Определите тип ингибирования ибупрофеном.
Задача 3. Гепарин – гликозаминокликан с сильным отрицательным зарядом – используется в клинической практике в качестве антикоагулянта. Действие гепарина состоит в связывании некоторых белков плазмы крови, в том числе атитромбина III – ингибитора свертывания крови. Связывание гепарина с антитромбином III в соотношении 1:1 вызывает конформационные изменения в белке, которые значительно усиливают его ингибирующую способность. Какие аминокислотные остатки антитромбина III могут участвовать во взаимодействии с гепарином? Какой тип взаимодействий возникает между этими остатками? Нарисуйте образование данных взаимодействий. Как изменится прочность этих связей, если рН сдвинуть в более кислую сторону, ответ поясните. Гепарин, обладая большим суммарным отрицательным зарядом, связывается со специфическими катионными участками антитромбина III, в результате конформация молекулы последней меняется и антитромбин III приобретает возможность инактивировать факторы свертывания (II, IX, X, XI, XII), калликреин, сериновые протеазы. Антитромбин содержит два функционально важных домена. Первый домен содержит активный центр и участок расщепления протеиназ, таких как тромбин, что является необходимым условием образования стабильного комплекса протеиназа-ингибитор. Второй является гликозаминогликан-связывающим доменом, ответственным за взаимодействие с гепарином и родственными соединениями, что ускоряет ингибирование тромбина. |