Главная страница
Навигация по странице:

  • Особенности биофизических методов

  • I. ТЕРМОДИНАМИКА БИОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ Основные понятия термодинамики.

  • Законы термодинамики Первый закон термодинамики – закон сохранения энергии

  • Второй закон термодинамики определяет направление протекания

  • Термодинамические потенциалы

  • Объединѐнная запись I и II законов ТД

  • Следствия I и II –го законов ТД

  • Закон Вант – Гоффа

  • Лекция Биофизика. Лекции по биофизике. Лекции по биофизике учебнометодическое пособие


    Скачать 1.98 Mb.
    НазваниеЛекции по биофизике учебнометодическое пособие
    АнкорЛекция Биофизика
    Дата21.03.2021
    Размер1.98 Mb.
    Формат файлаpdf
    Имя файлаЛекции по биофизике.pdf
    ТипЛекции
    #186920
    страница2 из 18
    1   2   3   4   5   6   7   8   9   ...   18
    Что изучает биофизика?
    Раздел 1. Общая биофизика. Включает в себя термодинамику биологических систем, кинетику биологических процессов, фотобиологию и молекулярную биофизику.
    Биологическая термодинамика, или термодинамика биологических
    систем, изучает процессы превращения вещества и энергии в живых организмах. Этот раздел биофизики до сих пор создает почву для дискуссий о том, выполняются ли законы термодинамики в живых организмах. Основу этому разделу положили уже упомянутые выше работы А. Лавуазье и
    П. Лапласа, доказавшие применимость первого закона термодинамики к живым системам. Дальнейшее развитие этого направления привело к описанию
    Гельмгольцем тепловых эквивалентов пищи. Наибольший вклад в этот процесс внес австрийский биофизик И. Пригожин, доказавший применимость второго закона термодинамики к биологическим системам и положивший начало учению о термодинамике открытых неравновесных систем.
    Кинетика биологических процессов – пожалуй, наиболее близкая к физике и химии область биофизики. Скорость и закономерности протекания реакций в живых системах мало отличаются от остальных. Эксклюзивным предметом является – учение о ферментах, о кинетике ферментативных реакций и способах регуляции ферментативной активности, описанная Михаэлисом и
    Ментен.
    Фотобиология, или квантовая биофизика – изучает взаимодействие излучений с живыми организмами. Видимый свет играет исключительно важную роль в биологии как источник энергии (фотосинтез) и информации
    (зрение). Здесь нужно отметить большой вклад русского ученого
    М. Ломоносова, предложившего трехкомпонентную теорию цветного зрения, нашедшую затем свое развитие в работах Юнга и Гельмгольца
    («Физиологическая оптика», 1867). Они описали оптическую систему глаза, явление аккомодации и изобрели «глазное зеркало» – офтальмоскоп, до сегодняшнего дня используемый при исследовании сетчатки.
    Молекулярная биофизика – раздел, тесно прилегающий к физической химии и изучающий закономерности образования и функционирования биомакромолекул. Этот раздел начал бурно развиваться лишь во второй половине XX века, так как требует сложного оборудования для проведения исследований. Здесь следует отметить работы Поллинга и Кори по изучению структуры молекул белка, Уотсона и Крика – по изучению молекулы ДНК.
    Раздел II. Биофизика клетки. Предметом данного раздела являются принципы организации и функционирования живой клетки и ее фрагментов, биологических мембран.

    9
    Этот раздел биофизики стал развиваться после появления клеточной теории Шванна. Были описаны структура и функция клеточных мембран
    (Робертсон, Синджер и Николсон), сформулированы представления об избирательной проницаемости мембран (В. Пфеффер и Х. де Фриз, Овертон), учение об ионных каналах (Эйзенман, Муллинз, Хилле).
    Эксперименты
    Э. Дюбуа-Реймона и теория
    В. Оствальда о трансмембранной разности потенциалов положили начало учению о биологическом электричестве, о возбудимых тканях и привели к пониманию закономерностей функционирования нервных и мышечных клеток.
    Механизмы передачи информации в клетках, учение о первичных и вторичных посредниках и внутриклеточных сигнальных системах – одно из активно развивающихся направлений современной биофизики. Ионы кальция, циклические нуклеотиды, продукты гидролиза мембранных фосфоинозитидов, простагландины, оксид азота – перечень молекул, передающих информацию от мембраны внутрь клетки и между клетками, постоянно пополняется.
    Раздел III. Биофизика сложных систем. Естественным этапом в развитии биофизики явился переход к описанию сложных биологических систем. Начав с исследования отдельных тканей и органов, сегодня биофизика анализирует процессы, протекающие на уровне целого организма, надорганизменных систем (популяций и экологических сообществ), биосферы в целом. Делаются попытки использовать биофизические подходы к анализу социальных процессов.
    Биофизика все глубже внедряется в медицину. Новые биофизические подходы находят применение в диагностике и лечении различных заболеваний.
    В качестве примеров можно назвать магниторезонансную томографию, воздействие электромагнитными волнами высокочастотного диапазона, методы клеточной терапии и т.д.
    Особенности биофизических методов
    Как упоминалось выше, принцип качественной несводимости в биофизике обуславливает необходимость «качественного сплава» методов физики и биологии. Биофизические методы исследования характеризуются рядом общих свойств.
    Во-первых, биофизика оперирует количественными методами, позволяющими измерить и объективно оценить исследуемое явление. Этот методологический принцип привнесен из физики.
    Во-вторых, биофизика рассматривает изучаемый объект в целом, не расчленяя его. Естественно, что любое измерение неизбежно вносит в изучаемую систему некоторые возмущения, но биофизические методы стремятся свести это возмущение к минимуму. По этой причине в настоящее время широкое распространение в биофизике получают такие методы, как инфракрасная спектроскопия, исследование отраженного света, флуоресцентные методы исследований.

    10
    В-третьих, важным методологическим принципом биофизики является
    «стратегия системного подхода». Биофизические методы основываются на неразрывности структуры и функции, рассматривая структурно-функциональные взаимосвязи в живых системах как основной принцип их организации.
    Названные особенности определяют биофизику как самостоятельное научное направление, имеющее собственный предмет исследований и методологические подходы. В следующих лекциях будут рассмотрены отдельные разделы биофизики, описаны достижения этой важной науки на современном этапе.
    Особое внимание будет уделено применению биофизических методов в биологии и медицине.

    11
    I. ТЕРМОДИНАМИКА БИОЛОГИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ
    Основные понятия термодинамики.
    Термодинамика (ТД) – наука, изучающая наиболее общие законы превращения различных видов энергии в системе.
    Различают
    термодинамику
    равновесных
    систем классическую, равновесную и термодинамику неравновесных систем линейную и нелинейную .
    Под термодинамической системой понимают часть пространства, ограниченную условно поверхностью оболочкой .
    Обязательными характеристиками термодинамической системы (М) является большое количество микрочастиц (m), размеры которых много меньше самой системы: m
    M.
    Различают 3 типа систем:
    Изолированная – не обменивается с окружающей средой ни веществом, ни энергией.
    Замкнутая (закрытая) – обменивается с окружающей средой только энергией.
    Открытая – обменивается с окружающей средой энергией и веществом.
    Термодинамическая система характеризуется определенными параметрами функциями , которые количественные описывают их состояние и подразделяются на:
    Экстенсивные, которые зависят от общего количества вещества в системе
    (масса, объем).
    Интенсивные, которые не зависят от общего количества вещества в системе (давление, температура).
    Термодинамические процессы – это процессы обмена энергией и веществом или переход энергии из одной формы в другую. Они бывают
    обратимые и необратимые.
    При обратимом процессе переход от начального к конечному состоянию, и наоборот, не требует дополнительных затрат энергии. Энергия переходит из одного вида к другому без потерь. Характеризует идеальные процессы.
    При необратимом процессе переход от конечного состояния к начальному требует дополнительных затрат энергии, так как процессы идут с частичными потерями энергии в виде тепла. Характеризует реальные процессы.
    Основная задача термодинамики – однозначное описание изменений в термодинамической системе при еѐ переходе из одного состояния в другое.
    Различают равновесное и неравновесноесостояние термодинамической системы:

    12
    Равновесным называется такое состояние системы, когда ее параметры не меняются с течением времени. Интенсивные параметры одинаковы во всех точках системы, т.е. градиенты этих параметров отсутствуют. Параметры системы не меняются с течением времени.
    Неравновесное называется такое состояние системы, когда ее параметры меняются с течением времени. Интенсивные параметры различны в разных точках системы, т.е. имеются градиенты этих параметров.
    Градиент – изменение параметра в пространстве. Существуют градиенты: температуры – Т/ х, концентрации – с/ х, давления – р/ х и т.д..
    Связи между параметрами системы называют уравнениями состояния.
    Изменение любого из параметров приводит к изменению состояния системы.
    Переход системы от одного состояния к другому происходит в результате различных процессов, которые подчиняются законам ТД.
    Законы термодинамики
    Первый закон термодинамики – закон сохранения энергии
    В качестве функции состояния наиболее показательна внутренняя энергия
    системы. Являясь суммой кинетической и потенциальной энергии всех атомов и молекул данной системы, она зависит от термодинамических параметров.
    ).
    ,
    ,
    ,
    (
    T
    V
    p
    m
    f
    U
    Ее производная
    U
    не зависит от пути перехода и является отражением
    I-го закона ТД:
    W
    Q
    U
    U
    U
    1 2
    , где
    Q
    и
    W
    – сообщенное тепло и совершаемая работа, над системой +), а
    ( - самой системой, соответственно.
    В дифференциальной форме I-ый закон ТД выглядит так
    W
    Q
    dU
    , где
    Q
    и
    W
    – сообщенное тепло и совершаемая работа, соответственно, не являются функциями состояния, так как это функции процесса, которые не могут быть выражены разностью начального и конечного значения и поэтому не имеют полного дифференциала.
    Следствием I-го закона термодинамики является закон Гесса, утверждающий, что тепловой эффект реакции не зависит от пути реакции, а только от начального и конечного состояния:
    H
    H
    H
    PV
    U
    V
    P
    U
    Q
    i
    j
    ju
    ik
    )
    (
    , где H-энтальпия, а ΔH – разница между энтальпией продуктов реакции
    (∑H
    ik
    ) и исходными продуктами (∑H
    ju
    ), РΔV- работа по изменению объѐма.

    13
    Доказательства применимости I–го закона ТД к живым системам были приведены с помощью методов прямой и непрямой калориметрии.
    Прямая калориметриясвязана с непосредственным определением количества энергии в системе при полном сжигании ее в замкнутом пространстве (калориметрическая бомба).
    Непрямая калориметрия основана на знании тепловых эквивалентов используемых с пищей веществ. В1904 г. Этуотер сконструировал дыхательный калориметр, измеряющий поток теплоты между его стенками, и поместил туда человека, измеряя количество калорий, выделяемых и потребляемых им с пищей в течение суток. В итоге измерений при минимальной работе, совершаемой человеком, оказалось, что эти величины
    (7784,1 кДж – потреблено с пищей и 7771 кДж – выделено) друг от друга отличались незначительно.
    Табл.1 Значение дыхательных коэффициентов и энергетических эквивалентов Q (энергия на 1 л О
    2
    ) при окисление органических веществ
    Наименование вещества
    Q, кДж л
    Углеводы
    1 21,0
    Белки
    0,8 18,8
    Жиры
    0,71 19,6
    Оба метода убедительно подтвердили применимость I-го закона ТД к биологическим системам.
    Второй закон термодинамики определяет направление протекания
    процесса.
    Для обратимых процессов отношение:
    Q
    const.
    S
    T
    ;
    S Дж/Кельвин
    функция состояния системы, названная энтропией, равна:
    Q
    dS
    T
    ,
    Второй закон термодинамики в дифференциальной форме:
    Q
    dS
    T
    0
    , так как в изолированной системе: Q 0 .
    Энтропия имеет вероятностную природу:
    0
    S
    K lnW , где
    0
    K
    – постоянная Больцмана,
    -23
    0
    K = 1,38 10
    Дж К
    -1
    , а
    1
    2
    n
    N !
    W
    N ! N ! N !
    , причем
    1
    2
    n
    N
    N
    N
    ..
    N - число вероятных состояний системы.
    Таким образом, I-й закон ТД определяет энергетический баланс в
    закрытой системе, а II-й – дает возможность установить направленность
    термодинамического процесса.

    14
    Термодинамические потенциалы
    По изменению
    U
    и
    S
    нельзя оценить величину производимой работы, их начальных и конечных значений. Для этого и вводят термодинамические потенциалы, которые выводятся из объединенной записи I-го и II-го законов термодинамики.
    Объединѐнная запись I и II законов ТД
    Q
    TdS ,
    TdS
    dU
    W ,
    dU
    W
    TdS .
    Видно, что изменение внутренней энергии складывается из двух компонентов:
    W
    – совершаемая работа – это свободная энергия,
    TdS
    – рассеянная в виде тепла – связанная энергия.
    Для количественной оценки свободной энергии необходимо наложить ограничения:
    1. При постоянном давлении P, работа по изменению объѐма будет равна
    PdV
    , а количество теплоты, согласно I-му закону ТД:
    Q
    U
    P V
    (U
    PV )
    H будет отражать изменение энтальпии – теплосодержание системы.
    dH
    dU
    PdV
    H
    U
    PV
    Т.е. энтальпия равна количеству теплоты, выделяемой системой.
    Зная энтальпию исходных веществ и продуктов реакции и основываясь на законе Гесса, можно определить еѐ тепловой эффект (см. стр.12)
    2. При постоянных V и T рассчитывается свободная энергия Гельмгольца.
    Совершаемая работа условно состоит из 2-х компонент:
    ПОЛЕЗНОЕ
    ПОЛЕЗНОЕ
    ПОЛЕЗНОЕ
    W
    W
    P V ,
    TdS
    dU
    W
    PdV ,
    W
    dU
    PdV
    TdS ,
    так как
    P V
    0
    ,
    ПОЛЕЗНОЕ
    W
    dU
    TdS
    dF – свободная энергия Гельмгольца.
    F
    U
    TS ,
    dF
    dU
    TdS.
    3. При постоянных P и T рассчитывается свободная энергия Гиббса:
    ПОЛЕЗНОЕ
    W
    dU
    pdV
    TdS
    dH
    TdS
    dG

    свободная энергия
    Гиббса, и она равна:

    15
    G
    H
    TS ,
    dG
    dH
    TdS ,
    Так как в биологических системах
    const
    p
    , чаще используют энергию
    Гиббса.
    Следствия I и II –го законов ТД
    1. Необратимый процесс всегда сопровождается рассеянием энергии в тепло
    TdS
    ;
    2. Если
    0
    dF
    или
    0
    dG
    , то процесс самопроизвольный и необратим, если
    0
    dF
    и
    0
    dG
    , то процесс не самопроизвольный и обратимый.
    3. При достижении равновесия
    F
    и min
    G
    , а
    dF
    и
    0
    dG
    Закон Вант – Гоффа
    Для идеального газа с учетом того, что свободная энергия Гиббса при полном дифференциировании: dG = dU + pdV + VdP – TdS – SdT = VdP-SdT, где:
    dG = VdP-SdT
    и постоянной температуре, получим:
    2
    1
    P
    2
    !
    P
    dP
    dP
    RT
    pV
    RT , V
    dG
    RT
    ,G
    RT
    RT(ln P
    ln P ).
    P
    P
    P
    Если первое состояние – в стандартных условиях и имеет стандартную величину
    0
    G
    , то итоговое значение свободной энергии Гиббса будет равно:
    0
    G
    G
    RT ln P .
    Для разбавленных растворов
    P
    C
    (концентрация) и тогда:
    0
    G
    G
    RT lnC .
    Для простого процесса
    A
    B
    в состоянии равновесия
    0
    G
    , тогда,
    0
    A
    G
    RT ln
    B
    а так как
    B
    A
    =
    P
    K
    (константа равновесия), получаем:
    0
    P
    G
    RT ln K
    закон Вант – Гоффа
    (
    0
    G
    – изменение
    G
    при протекании процесса в стандартных условиях).
    В биологических системах процессы обычно сопровождаются еще изменением количества вещества и в таком случае:
    dU
    TdS
    pdV
    dN , где
    dN
    – изменение числа частиц,
    – химический потенциал (градиент).
    dG
    SdT
    Vdp
    dN .

    16
    Химический потенциал равен изменению термодинамического потенциала, приходящегося на одну частицу вещества в соответствующем процессе. Он не является термодинамическим потенциалом и служит параметром системы.
    1
    2
    N
    RT ln
    N
    Все выше изложенное разработано для закрытых и изолированных систем, находящихся в состоянии термодинамического равновесия. При этом состоянии, когда: S max.,F 0,G 0, S 0, F 0, G 0 , процессы не протекают, материя мертва, так как система не может самопроизвольно выйти из этого состояния.
    Живые системы находятся в стационарном состоянии. При этом скорость протекания процессов остается постоянной, то есть:
    S , F , G
    0
    , но
    F
    и
    0
    G
    , а max
    S
    (здесь
    F
    и
    G
    становятся функциями от времени).
    Равновесие в живой системе поддерживается за счет баланса протекающих процессов.
    1   2   3   4   5   6   7   8   9   ...   18


    написать администратору сайта