ГенетЗадачникЧасть2. Сцепленная с полом наследственность и сцепление генов
Скачать 175.5 Kb.
|
1-й способ. Так как общее число аллелей (А + А') принято нами за 100%. а частота (р%) аллеля А составляет 80%, то частота (q%) аллеля А' равна: q% = 100% — 80% = 20% Как легко заметить, применяя этот способ, мы исходим из формулы: р% + q% = 100% преобразуя ее для определения величины q, получаем: q% = 100% - p% 2-й способ. Согласно 1-му способу мы получили частоту q% аллелей А' путем вычитания частоты р% аллелей А из общего числа аллелей (100%) в популяции. Однако частоту q% можно получить и непосредственно, из данных о генетическом составе популяции. При этом нужно рассуждать так же, как при определении частоты р%, а именно, 4% гомозигот A'A' имеют 4% от общего числа аллелей в популяции и все они А'; 32% гетерозигот АА' имеют 32% от общего числа аллелей в популяции и половина из них (16%) — аллели А'. Так как аллели А' содержатся только в этих двух группах особей, то общее число аллелей А' составляет: q% = 4% + 16% = 20% результат вполне совпадает с результатом, полученным первым способом. * * * Одна из задач популяционной генетики заключается в определении генетической структуры популяции. Если по той или другой паре аллельных генов генотипы особей могут быть определены по их фенотипу, эта задача не представляет особой сложности. Выше было показано, что например, по системе MN групп крови все три генотипа (LMLM, LNLN и LMLN) могут быть определены серологическими методами, что дает возможность эмпирически установить частоты этих генотипов и вычислить частоты аллелей LM и LM в различных популяциях. То же самое относится к другим парам аллельных генов, если не только гомозиготы, но и гетерозиготы отличаются фенотипически. Следовательно, это относится к парам кодоминантных аллелей, и аллелей с неполным доминированием или промежуточным наследованием. Однако существует обширная группа аллеломорфных пар, с полным доминированием. Примером могут служить альбинизм, болезнь Тей Сакса, фруктозурия, муковисцидоз и др. Известно например, что при болезни Тей Сакса (детская форма амавротической семейной идиотии), вызываемой аутосомным рецессивным геном, частота больных детей (генотип tt) составляет 4×10-6. При этом в группу здоровых попадают гомозиготы — TT и гетерозиготы — Tt, которые фенотипически друг от друга не отличаются. Поэтому, пользуясь изложенными выше методами, мы не можем, например, вычислить ни частоты здоровых гомозигот (ТТ), ни частоты гетерозиготных носителей (Tt), ни частоты аллелей Т и t. Для того, чтобы подойти к решению этих задач, нужно познакомиться с условиями, от которых зависит генетическая структура популяций. К числу этих условий относится, во-первых, частота аллелей в популяции предшествующего поколения. Действительно, каждый человек получает аллели от своих родителей, в связи с чем очевидно, что частота тех или других аллелей в популяции данного поколения зависит от частоты этих аллелей в предшествовавшем поколении. Например, если в поколении родителей аллель А был распространен очень широко, а аллель а — редко, то и в поколении потомков генотип АА будет преобладать над генотипом Аа и аа. Во-вторых, на генетический состав популяции влияет мутационный процесс. Если в результате мутаций в поколении родителей аллель А с большей частотой мутирует в аллель а, чем а в А, то это, так называемое, мутационное давление, должно влиять на соотношение генотипов в популяции потомков, увеличивая частоту аллеля а (приток аллелей а в популяцию). В-третьих, в отличие от распространенного мнения, в популяциях людей происходит отбор. Многие мутантные гены снижают жизнеспособность человека, в результате чего особи, имеющие данный ген, нередко умирают, не оставив потомства, иди имеют сниженное по сравнению со своими нормальными сибсами число потомков. В результате этого происходит элиминация мутантного аллеля. Его частота в популяции снижается (отток, аллелей из популяции). К числу таких генов относятся летальные, полулетальные аллели, и многие гены вызывающие более или менее серьезный наследственный дефект. Наконец, состав популяции зависит от типа браков. Отличают панмиксию, или свободное вступление в брак (без подбора партнера по генотипу), от неслучайного подбора брачных пар, при котором партнер оказывает предпочтение особям с тем же генотипом (положительный подбор) или с противоположным генотипом (отрицательный подбор пар). Тип брака должен устанавливаться по отношению к конкретному наследственному признаку. Например, в популяции определенного города или района, подбор брачных пар по группам крови происходит независимо от генотипа (панмиксия), но по росту в зависимости от генотипа: люди высокого роста чаще вступают в брак с высокими же, а низкорослые, с низкорослыми (неслучайный положительный подбор пар). К. Штерн отмечает, что и при некоторых других генотипах, например при глухонемоте и некоторых психических заболеваниях нередки браки между лицами, обладающими одинаковыми наследственными признаками. Однако на большинство наследственных свойств такой выбор не распространяется и, следовательно, панмиксия встречается достаточно широко. Панмиксия в человеческом обществе ограничивается также тем, что популяции некоторых местностей и городов состоят из относительно изолированных групп, в которых браки заключаются преимущественно (а иногда даже полностью) в пределах своей группы. Такие группы называются изолятами. В человеческих популяциях изоляты существуют на почве национальных, религиозных, расовых, сословных и др. разделений общества. Изоляты, входящие в популяцию одного и того же города или местности, могут сильно отличаться в генетическом отношении друг от друга. Например, популяции городов США состоят из резко обособленных друг от друга групп белых, негров, пуэрториканцев. В некоторых городах США существуют изоляты лиц, происходящих от итальянских, греческих и других переселенцев. Во многих странах Африки и Азии изоляты существуют на базе племенного и кастового разделения общества. Основная закономерность, позволяющая исследовать генетический состав популяции при панмиксии, была установлена в 1908 году независимо друг от друга английским математиком Г. Гарди и немецким врачем В. Вейнбергом. Закон Гарди-Вейнберга устанавливает, что если в популяции ген А встречается с частотой р, а его аллель А' с частотой q, причем p + q = 1.......................(1) то при условии панмиксии и при отсутствии мутационного давления и отбора в первом же поколении устанавливается равновесие генотипов АА, АА¢ и А¢А¢, сохраняющееся и во всех последующих поколениях. Равновесие выражается формулой: р2 (АА) + 2pq(AA¢) + q2 (A¢А¢) .......... (2) В этой формуле коэффициенты при генотипах АА, АА¢ и А¢А¢ отвечают равенству: р2 + 2рq + q2 = 1..............(3) Приведенные формулы нуждаются в пояснении. Единица, стоящая в правой части уравнения (3), показывает, что общее число особей популяции принято нами за единицу, и следовательно частоты генотипов и аллелей выражаются в долях единицы; р2 — выражает частоту гомозигот с генотипом AA, q2 — частоту гомозигот с генотипом А'А¢, 2pq — частоту гетерозигот (АА'). Эта формула дает при исследовании панмиктических популяций большие возможности. Она позволяет вычислить, например, частоту гетерозиготных носителей в популяции даже в тех случаях, когда они фенотипически неотличимы oт гомозигот. Однако, перед тем как говорить о практическом применений этой формулы, разберем условия возникновения равновесия генотипов в панмиктических популяциях. Рассмотрим задачу 152. Согласно условиям этой задачи исходная группа особей состоит из 50% особей АА и 50% аа. Нужно показать, что при панмиксии в первом же поколении. возникнет равновесие генотипов АА, Аа и аа, подчиняющееся закону Гарди-Вейнберга и вычислить, частоты генотипов АА, Аа и аа. Так как число особей с генотипами АА и аа в исходной! группе одинаково, то одинаково и число аллелей А и а, то есть частота аллелей А, обозначаемая нами как р, равна 0,5 (50%) и частота аллелей а, обозначаемая как q, тоже равна 0,5 (50%). При этом: p + q = 0,5 + 0,5 = 1 Так как гаметы содержат по одному аллелю, то в этой группе особей частота сперматозоидов с аллелем А составит 0,5 и с аллелем а тоже 0,5. То же соотношение имеет место и среди яйцеклеток. Чтобы определить какое потомство получится при свободном подборе брачных пар (панмиксии), используем для расчета генотипов потомства разобранный нами выше алгебраический способ. Изобразим типы сперматозоидов и их количество в виде двучлена — (0,5А+0,5а) и таким же образом типы яйцеклеток. Произведя умножение двучленов, получим: (0,5А+0,5а) (0.5А + 0,5а) = 0,25АА + 0,50Аа+ 0,25аа Результат соответствует формуле Гарди-Вейнберга при условии, что р = q = 0,5. Действительно, по формуле Гарди-Вейнберга: частота генотипа АА = р2 = 0,52 = 0,25 частота генотипа Аа = 2pq =2 × 0,5 × 0,5 = 0,5 частота генотипа аа = q2 = 0,52 = 0,25 что совпадает с вычисленными нами частотами генотипов. Нетрудно показать, что возникшая популяция находится в состоянии равновесия, то есть, что и в последующих локолениях в этой популяции генотипы АА, Аа и аа будут поддерживаться в той же пропорции — 0,25 : 0,50 : 0,25. Действительно, если плодовитость особей всех трех генотипов одинакова, то организмы АА дадут 25% от общего числа гамет популяции, причем все они с аллелем А. Гетерозиготы Аа дадут 50% общего числа гамет, из которых 25% с аллелем А и 25% с аллелем а, и, наконец, организмы аа дадут 25% гамет, все с аллелем а. Суммируя, получаем: 50% (0,5) гамет А и 50% (0,5) гамет а. Так как соотношение гамет осталось прежним р = q = 0,5, то и соотношение генотипов особей следующего поколения должно быть таким же, как в предыдущем. Оно сохранится при условии панмиксии и во всех последующих поколениях. Рассмотрим задачу 153. Согласно, условиям задачи исходная группа особей состоит из 90% особей с генотипом ВВ и 10% особей с генотипом bb. В такой группе частота аллелей В, обозначаемая нами как p, равна 0,9, а частота аллелей b, обозначаемая как q = 0,1, причем p + q = 0,9 + 0,1 = 1. Рассмотрим, какое соотношение генотипов установится в популяции возникшей из исходной группы особей, при условии панмиксии. Так как гаметы содержат по одному аллелю, то в исходной группе доля сперматозоидов с аллелем В составит 0,9, с аллелем b — 0,1, а общее число сперматозоидов может быть. представлено двучленом (0,9В + 0,1b). Таким же двучленом могут быть представлены яйцеклетки. Генотипы потомства, так же как в предыдущем примере, можно рассчитать алгебраическим путем: (0,9В+0,1b) (0,9В+0,1b) = 0,81 BB+0,18Bb+0,01bb Расчет показывает, что 81% особей первого поколения будут гомозиготами ВВ, 18% гетерозиготами Вb и 1% гомозиготами bb, что соответствует формуле Гарди-Вейнберга при условии, что р = 0,9, a q = 0,1. Действительно, по формуле: частота генотипа BB = р2 = 0,92 = 0,81 частота генотипа Вb = 2pq = 2 × 0,9 × 0,1 = 0,18 частота генотипа bb = q2 = 0, l2 = 0,01 Чтобы выяснить, находится ли возникшая популяция в состоянии равновесия, нужно установить останется ли в этой популяции соотношение гамет с аллелем В и аллелем b — таким же как в предыдущем поколении. Если плодовитость особей всех трех генотипов одинакова, то 81% гомозигот BB дадут 81% гамет с аллелем В, 18% гетерозигот (Bb) дадут 9% гамет с аллелем В и 9% —-с аллелем b и, наконец, 1% гомозигот bb дадут 1% гамет с аллелем b. Суммируя, получаем: 90% (0,9) гамет с аллелем В и 10% (0,1) с аллелем b. Так как соотношение аллелей осталось прежним (р = 0,9; q = 0,1), то и соотношение генотипов особей следующего и всех последующих поколений данной популяции останется неизменным. Другими словами популяция находится в состоянии равновесия. Значение закона Гарди-Вейнберга заключается в том, что он позволяет исследовать генетическую структуру популяций. Однако не лишне напомнить, что применение этого закона ограничивается рядом условий, к числу которых относятся: 1) наличие нанмиксии, то есть свободного подбора брачных пар, без тенденции вступления в брак с партнерами подобными или противоположными по генотипу; 2) отсутствие притока аллелей, вызываемого мутационным давлением; 3) отсутствие оттока аллелей, вызываемого отбором; 4) равная плодовитость гетерозигот с гомозиготами; 5) поколения не должны перекрываться во времени; 6) численность популяции должна быть достаточно большой. Дж. Ниль и У. Шелл отмечают, что хотя ни в одной конкретной человеческой популяции эта совокупность условий не может быть выполнена, однако во многих случаях расчеты по закону Гарди-Вейнберга настолько близки к действительности, что закон оказывается вполне пригодным для анализа генетической структуры панмиктических популяций. Для медицинской генетики, особенно важно то, что закон часто может быть использован для анализа популяций даже по патологическим генам, снижающим жизнеспособность и плодовитость особей. Это связано с тем, что в длительно существующих панмиктических популяциях отток патологических аллелей, вызываемый естественным отбором (с элиминацией особей со сниженной жизнеспособностью), уравновешивается притоком тех же аллелей, происходящем в результате мутационного давления. Имеет значение и другое обстоятельство. В популяциях животных и растений нередко наблюдается такая ситуация, когда гетерозиготы (Аа) более плодовиты, чем обе гомозиготные формы (АА и аа). Это приводит к отклонению от предусмотренных законом Гарди-Вейнберга частот генотипов. Для популяций современного человечества указанная ситуация очевидно не имеет такого значения, так как число детей в современной семье отнюдь не отражает генетически обусловленной плодовитости родителей, и повышение плодовитости гетерозигот не приводит к увеличению числа детей в их семьях. Рассмотрим применение закона Гарди-Вейнберга для характеристики генетической структуры популяций. По условиям задачи 155 в родильных домах, обслуживающих город К., из 84000 детей, родившихся в течение 10 лет, у 210 детей обнаружен патологический рецессивный признак l (генотип 11). Предполагается, что популяция города К. отвечает условиям панмиксии. Требуется определить: а) частоту аллелей L и l в популяции города К; б) частоту гетерозиготных носителей (L1); в) генетическую структуру популяции, установив частоты генотипов LL, L1 и 11. При определении частоты (р) аллеля L и частоты (q) аллеля 1 в поколении младенцев, родившихся в течение 10 лет, нужно иметь в виду, что частоты аллелей в популяции связаны выражением p + q = 1. Условия задачи содержат сведения о величине q2, которая представляет собой частоту детей с генотипом 11 (210 детей 11 из 84000 новорожденных). Следовательно: q2 = 210/84000 = 0,0025 Зная величину q2, можно, путем извлечения квадратного корня (для извлечения квадратного корня и других вычислений целесообразно пользоваться таблицами логарифмов) установить величину q (частоту аллеля I): q = Öq2 = Ö 0,0025 = 0,05, а так как p+q = 1, или р = 1 — q, то р = 1 — 0,05 = 0,95 Следовательно, в поколении родившихся младенцев частота (р) аллеля L равна 0,95 (или 95%), а частота (q) аллеля I равна 0,05 (или 5%). Вычисленные нами частоты аллелей L и l характеризуют поколение младенцев, родившихся в городе К. в течение 10 лет. Так как по условиям задачи исследуемая популяция отвечает требованиям панмиксии, то и среди взрослого населения города имеется та же самая частота генов L и 1. Зная частоту аллелей, легко ответить и на второй вопрос задачи — какова относительная частота гетерозиготных носителей (L1) в популяции города К. Напомним, что относительная частота генотипов в панмиктической популяции подчиняется закону Гарди-Вейнберга, согласно которому такие популяции состоят из: p2(LL) + 2pq(Ll)+q2(ll) Следовательно, относительная частота гетерозигот (L1) равна 2pq. Величины р и q были вычислены нами выше и равны: р = 0,95, q = 0,05. Откуда 2pq — 2 • 0,95 • 0,05 = 0,095 или 9,5%. В целом, популяция города К. состоит из особей, имеющих следующую частоту генотипов: частота генотипа LL; р2 = 0,952 = 0,9025 или 90,25% частота генотипа L1; 2pq = 2 • 0,95 • 0,5 = 0,095 или 9,5% частота генотипа 11; q2 = 0,052 = 0,0025 или 0,25%. Задачи Задача 139. При определении MN групп крови в популяции города Р. установлено, что из 4200 обследованных 1218 человек имели антиген М (генотип LMLM, 882 человека антиген N (генотип LNLN) и 2100 человек оба антигена (генотип LMLN). а) Определить частоту всех трех генотипов, выразив ее в процентах. б) Определить частоту этих же генотипов, выразив ее в долях единицы. Задача 140. При определении MN групп крови в популяции коренного населения Австралии, из 2800 обследованных 84 человека имело антиген М (генотип LMLM), 1876 человек — антиген N (генотип LNLN) и 840 человек оба антигена (генотип LMLN). а) Вычислить частоту всех трех генотипов в популяции, выразив ее в процентах. б) Вычислить частоту этих же генотипов, выразив ее в долях единицы. Задача 141. При определении MN групп крови в популяции эскимосов восточной Гренландии установлено, что из 3000 обследованных 2505 имели генотип LMLM, 27— генотип LNLN и 468 — генотип LMLN. а) Определить частоту всех трех генотипов, выразив ее в процентах. б) Определить частоту этих же генотипов, выразив ее в долях единицы. |