Главная страница
Навигация по странице:

  • Дезоксирибозимы

  • Субстратная специфичность

  • Хемоселективность или функциональная селективность

  • Региоселективность субстрата

  • Энантиоселективность биокатализатора

  • история. 1. понятие биотрансформации. Виды биокатализаторов


    Скачать 4.48 Mb.
    Название1. понятие биотрансформации. Виды биокатализаторов
    Анкористория
    Дата21.10.2022
    Размер4.48 Mb.
    Формат файлаdocx
    Имя файлаvasilova_bilety.docx
    ТипЛекции
    #747199
    страница1 из 9
      1   2   3   4   5   6   7   8   9

    ЛЕКЦИИ

    МИКРОБИОЛОГИЧЕСКАЯ ТРАНСФОРМАЦИЯ ОРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ

    25.10.2021

    1.ПОНЯТИЕ БИОТРАНСФОРМАЦИИ. ВИДЫ БИОКАТАЛИЗАТОРОВ.


    Биотрансформация представляет собой процесс химической модификации субстрата в присутствии биологического объекта – биокатализатора.



    Субстратами в процессах биотрасформации могут выступать различные органические и неорганические соединения. В отличие от процессов биосинтеза, также осуществляемых с помощью биологических объектов, в которых субстрат претерпевает значительные структурные изменения, превращаясь сначала в один из углеродных предшественников и лишь затем в практически важный продукт. В процессах биотрансформации субстрат подвергается лишь небольшим изменениям. Например, практически важная яблочная кислота может быть получена биотрансформацией фумаровой кислоты, в ходе которой к субстрату присоединяется молекула воды.



    В качестве биокатализаторов используются клетки живых организмов, а также их компоненты, обладающие каталитической активностью.

    Каталитически активным компонентом клетки, прежде всего, относятся ферменты, имеющие белковую природу. Кроме того, каталитической активностью обладают некоторые молекулы РНК и ДНК, называемые рибозимами и дезоксирибозимами.

    Рибозимы – это небольшие молекулы РНК, способные осуществляться сплайсинг, в ходе которого из субстрата молекулы РНК вырезается целый фрагмент. При этом не требуется участие какого-либо фермента, поскольку рибозимы сами катализируют этот процесс.

    Дезоксирибозимы – это небольшие одноцепочечные молекулы ДНК, которые также могут участвовать в модификации молекулы РНК.

    В качестве биокатализаторов могут участвовать клеточные комплексы, например, рибосомы, осуществляющие внеклеточный синтез белка. Кроме того, на основе клеточных компонентов могут быть созданы искусственные комплексы и молекулы, обладающие каталитической активностью. К ним относятся аптазимы и абзимы.

    Абзимы – это комплексы, состоящие из моноклонального антитела и фермента. Благодаря антителу, фермент приобретает свойство работать с молекулой субстрата, узнаваемым антителом.



    Аптазимы – это химерные молекулы, состоящие из аптамерного и рибозимного модулей.



    Аптамеры представляют собой молекулы одноцепочечных нуклеиновых кислот, чьи свойства сравнимы с моноклональными антителами, имеющими белковую природу. Они также могут узнавать определенные молекулы, в связи с чем, каталитическая активность рибозима может регулироваться с помощью небольших молекул: олигонуклеотидов или пептидов, присоединяющихся к регуляторному участку.

    В настоящее время, наиболее широко в процессах биотрансформации используются препараты ферментов или клетки микроорганизмов. В клеточных катализаторах также работают ферменты, локализованные на поверхности или внутри клетки. В случае грибов и актиномицетов для трансформации могут быть использованы не только вегетативные клетки, но и споры.

    Многие биотрансформации доведены до промышленного уровня.


    2.ДОСТОИНСТВА И НЕДОСТАТКИ БИОКАТАЛИЗАТОРОВ


    Если сравнивать биокатализаторы с катализаторами традиоционно-использующимися в химических синтезах, можно выделить несколько наиболее существенных преимуществ биологических объектов:

    Во-первых, биокатализаторы могут проявлять высокую избирательность:

    - субстратную селективность

    - хемоселективность

    - региоселективность

    - энантиселективность

    Напротив, традиционные катализаторы вообще не проявляют или отличаются неудовлетворительной избирательностью.

    Субстратная специфичность биокатализатора обусловлена его способностью трансформировать определенные соединения, смеси различных, в том числе, химически родственных соединений. Триозофосфатизомераза изомеризует 3-ФГА в соответствующий кетон, но не превращает гомологичную молекулу рибозо-5-фосфата в рибулозо-5-фосфат.



    Хемоселективность или функциональная селективность биокатализатора заключается в его способности выборочно воздействовать на одну функциональную группу в присутствии в молекуле другой одинаково или даже более реактивной группы. Например, оксидоредуктазы могут окислять оксиметильную группу субстрата, но не затрагивать его вторичную окси группу. В результате окисления образуется соответствующий альдегид.



    Региоселективность субстрата проявляется в его способности избирательно модифицировать одну из двух или нескольких одинаковых функциональны групп, расположенных в разных местах молекулы. Например, при трансформации адипонитрила, нитрилгидратаза может восстанавливать только одну из двух имеющихся одинаковых нитрильных групп.

    (в результате реакции выделяется аммиак)

    Энантиоселективность биокатализатора связана с его способностью избирательно трансформировать только один из двух возможных энантиомеров субстрата. Энантиоселективные свойства проявляются в отношении хиральных соединений, у которых имеется хиральных атом углерода, взаимодействующий с четырьмя различными заместителями. Например, аминокислоты и их n-ацилированные производные содержат хиральные центры и могут существовать в виде двух энентиомеров, а именно D и L по старой номенклатуре, или S и R по современной номенклатуре.



    Некоторые ацилазы могут гидролизовать L- энантиомеры эфиров, с образованием L аминокислот. Но практически не работают с D изомерами.



    При работе с прохиральными субстратами энантиоселективные биокатализаторы образуют только один из энантиомеров хирального продукта. Например, при восстановлении ацетофенона с помощью энантиоселективных карбонилредуктазами может получиться либо R, либо S энантиомер 1-фениоэтанола в зависимости от типа фермента.



    Во-вторых, достоинством биокатализаторов является также то, что они обычно работают при умеренных температурах и давлениях. Это предотвращает протекание нежелательных сопутствующих процессов таких, как спонтанное разложение продуктов реакции, полимеризация веществ. Данные процессы зачастую имеют место в органическом синтезе, выполняющимися более экстремальных условиях. Они не только существенно снижают выход целевого продукта, но и создают серьезные проблемы при его выделении.

    В-третьих, благодаря высокой субстратной специфичности биокатализаторов, их способности работать в одинаковых условиях можно осуществлять в политрансформации субстрата в одном реакторе. Это весьма важно, поскольку удается осуществить многостадийный синтез без выделения промежуточных продуктов.



    В-четвертых, в отличие от катализаторов на основе тяжелых металлов, биокатализаторы являются биодеградабельными веществами и, следовательно, не накапливаются в окружающей среде, т.е. являются экологически безопасными.

    В-пятых, биокатализаторы в отличие, например, от металлокомплексных катализаторов имеют более низкую себестоимость, могут быть многократно использованы, а иногда, могут быть даже регенерированы.

    К существенным недостаткам многих биокатализаторов относятся их низкая стабильность в органических растворителях. Это ограничивает их применение в процессах, которые можно реализовать исключительно в таких условиях. Вместе с тем, известны биокатализаторы, которые могут достаточно эффективность работать не только в неполярных, но и в ряде полярных растворителей. При этом, в органических растворителя некоторые биокатализаторы начинают осуществлять новые превращения, которые нехарактерны для них в естественных водных системах. В частности, к ферментам работающим в органических растворителях относятся липазы. Природными субстратами этих ферментов являются 3-ацилглицириды, однако многие липазы проявляют широкую субстратную специфичность и могут гидролизовать в водных растворах весь разнообразные сложные эфиры.



    Безводных органических растворителях эти ферменты катализируют обратный процесс, то есть синтез эфиров.



    Более того, в органических растворителях у липаз появляются дополнительные возможности синтезировать эфиры в реакциях ацедолиза, алкоголиза, переэтерификации, аминолиза и аммонолиза исходных эфиров.

    В ходе ацедолиза эфир синтезируется путем взаимодействия с карбоновой кислотой другого исходного эфира под действием липазы.



    Напротив, при алкоголизе эфир образуется в присутствии спирта.



    В случае аминолиза и аммонолиза, вместо спирта используется амин или аммиак.



    При переэтерификации эфир синтезируется в обменной реакции между двумя исходными эфирами.



    В качестве растворителей в процессе этерификации субстратов растворимых гидрофобных неполярных растворителях могут быть использованы такие органические растворители, как гексан, гептан, изооктан.

    Для субстратов нерастворимых в этих растворителях приходится использовать более полярные растворители, например, хлороформ, толуол, трепбутонол. Однако активность большинства липаз в этих растворителях значительно подавляются. В сильно полярных растворителях таких, как ацетон, диметилформалид, диметилсульфоксид большинство липаз не работает.

    Стабильность некоторых биокатализаторов в органических растворителях может быть увеличено путем их модификации.

    Следующим недостатком биокатализаторов, является их способность ингибироваться токсичными продуктами или субстратами реакции. Это ограничивает возможность проведения трансформации в условиях высоких концентраций субстрата и существенно снижает выход целевого продукта. Однако и в этом случае, существуют разнообразные способы защиты биокатализаторов от токсичных соединений. Например, токсичный продукт можно непрерывно выводить из реакционной смечи в ходе трансформации.

    Также к недостаткам биокатализаторов по сравнению с неорганическими катализаторами можно отнести необходимость более строго контролировать параметры процесса такие, как рН, температура, концентрация солей и другие. Поскольку ферменты наиболее активно работают в довольно узком диапазоне оптимальных условий.
      1   2   3   4   5   6   7   8   9


    написать администратору сайта