|
|
Кафедра биологической химии
Напишите формулу гексапептида Лиз-Вал-Глу-Фен-Ала-Асп.
Выделите в пептиде повторяющиеся группы, образующие пептидный остов, и вариабельные группы, представленные радикалами аминокислот.
Подчеркните пептидные связи.
Напишите другой пептид, состоящий из тех же аминокислот.
Выберите из представленных пар аминокислот консервативные и радикальные замены:
1. гли – ала;
2. глу – вал;
3. асп – глу;
4. тир – фен;
5. вал – лей.
Пользуясь приводимой ниже последовательностью аминокислотных остатков в окситоцине (1), вазопрессине быка (2) и вазопрессине свиньи (3):
а) проиллюстрируйте принцип взаимозаменяемости аминокислот;
б) выделите аминокислоту, обусловливающую видовую специфичность вазопрессина.
Цис – тир – илей – глу – асп – цис – про – лей – гли;
Цис – тир – фен – глу – асп – цис – про – арг – гли;
Цис – тир – фен – глу – асп – цис – про – лиз – гли.
Какая форма полипептидной цепи термодинамически более выгодна в водном растворе – полностью развернутая цепь или клубок? Обоснуйте свой ответ.
Систематизируйте представленный в учебниках материал с помощью таблицы:
-
Классы сложных белков
|
Структура
небелковых компонентов
|
Отдельные представители
|
|
|
|
Проведите сравнительную характеристику структуры и свойств миоглобина и гемоглобина с помощью таблицы:
-
Структурно-функциональные
особенности
|
Миоглобин
|
Гемоглобин
|
Характеристика небелковой части
|
|
|
Высший уровень организации нативной молекулы
|
|
|
Количество субъединиц, типы протомеров
|
|
|
Количество гемов в молекуле
|
|
|
Валентность железа в функционально активной молекуле
|
|
|
Биологическая функция
|
|
|
График зависимости насыщения кислородом от его парциального давления Р
|
|
|
Степень насыщения кислородом в капиллярах покоящейся мышцы (Р = 40 мм.рт.с.т)
|
|
|
Степень насыщения кислородом в капиллярах работающей мышцы (Р = 10 мм.рт.с.т)
|
|
|
Литература
Николаев А.Я. Биологическая химия. – М.: Высшая школа, 1989. –
С. 18-33.
Березов Т.Т., Коровкин Б.Ф. Биологическая химия. – М.: Медицина, 1990. – С. 19-76.
Березов Т.Т., Коровкин Б.Ф. Биологическая химия. – М.: Медицина, 1998. – С. 19-32, 44-68.
Задания на самоподготовку по биологической химии.
Задания для самостоятельной работы студентов лечебного и медико-профилактического факультетов.
Тестовые задания по биохимии.
Лекционный материал.
Лабораторная работа. Алейникова Т.В., Рубцова Г.В. Руководство к практическим занятиям по биологической химии. – М.: Высшая школа, 1988. – Лабораторные работы №№ 5, 6, 7, 10.
Северин Е.С., Николаев А.Я. Биохимия. Краткий курс с упражнениями и задачами. – М.: ГЭОТАР-МЕД, 2001. – С. 7-29.
Тема 1.3. СТРУКТУРА И СВОЙСТВА ФЕРМЕНТОВ.
Вопросы для самоподготовки
Как называются специализированные белки, обладающие каталитической активностью?
Какова биологическая роль ферментов?
Приведите доказательства белковой природы ферментов.
Назовите общие признаки, присущие биологическим и неорганическим катализаторам.
Назовите признаки фермента, принципиально отличающие его от небиологических катализаторов.
Составьте энергетическую диаграмму химической реакции без катализатора и в его присутствии, показав средний энергетический уровень молекул, вступивших в реакцию и образующихся в результате реакции, и значение энергии активации неферментных реакций А + В = С и ферментной реакции. Сделайте вывод о том, каким образом ферменты повышают скорость химической реакции.
Какие Вы знаете виды специфичности ферментов?
Приведите пример ферментов, обладающих абсолютной субстратной специфичностью действия.
Приведите пример ферментов, обладающих относительной субстратной специфичностью действия.
Приведите пример ферментов, обладающих стереоспецифической субстратной специфичностью.
На какие группы по строению делятся ферменты?
Приведите примеры простых ферментов.
Приведите примеры сложных ферментов.
Из каких двух частей состоит молекула сложного фермента?
Как называется природный комплекс белкового и небелкового компонента фермента?
Как называется белковая часть холофермента?
Перечислите основные функции апофермента в катализе.
Как называется небелковая часть холофермента, прочно связанная с апоферментом?
Как называется небелковая часть холофермента, непрочно связанная с апоферментом?
Из приведенных соединений назовите кофакторы ферментов: аминокислоты, витамины, гормоны, ионы металлов, полисахариды.
На какие группы делятся кофакторы?
Приведите примеры металлозависимых ферментов.
Какова роль иона металла в каталитической активности фермента?
Назовите коферменты, являющиеся активными формами витаминов.
Перечислите функции коферментов.
Как называются ферменты, которые существуют не менее чем в двух молекулярных формах, встречающиеся в одной и той же ткани?
Сколько изоформ образует лактатдегидрогеназа?
Как построена каждая из изоформ лактатдегидрогеназы?
Каким методом можно разделить изоформы лактатдегидрогеназы?
Как различаются изоформы по своей каталитической активности?
Какими факторами определяется распространение изоформ фермента в различных тканях и органах?
Каковы структурные особенности строения фермента?
На уровне какой структуры белка образуется активный центр фермента?
Какие основные закономерности можно отметить в строении активного центра?
Какие радикалы наиболее часто входят в активный центр?
Какие функциональные группы наиболее часто входят в состав активных центров ферментов?
Назовите активные центры молекулы фермента.
Какую функцию выполняет субстратный центр?
Приведите примеры видов связей, образующихся между химическими группами субстрата и субстратного центра.
Чем объясняется высокая специфичность действия субстратного центра?
Какую функцию выполняет каталитический центр?
Какую функцию выполняет аллостерический центр фермента?
Назовите основные этапы ферментативной реакции.
Запишите в общем виде ферментативную реакцию в соответствии с выделенными этапами.
Чем отличается неактивированный и активированный комплексы фермента и субстрата?
Какая из этих стадий лимитирует скорость ферментативной реакции?
Назовите гипотезы, объясняющие механизм действия фермента.
В чем сущность гипотезы «предшествующего соответствия»?
В чем сущность гипотеза «индуцированного соответствия»?
|
|
|
Скачать 1.43 Mb.