Главная страница

Курс лекций по биоорганической химии. Курс лекций по биоорганической химии учебное пособие для студентов 1 курса очного обучения


Скачать 4.37 Mb.
НазваниеКурс лекций по биоорганической химии учебное пособие для студентов 1 курса очного обучения
АнкорКурс лекций по биоорганической химии.doc
Дата25.06.2018
Размер4.37 Mb.
Формат файлаdoc
Имя файлаКурс лекций по биоорганической химии.doc
ТипКурс лекций
#20733
страница25 из 26
1   ...   18   19   20   21   22   23   24   25   26

Для проверки усвоения темы рекомендуем ответить на вопросы:
1. Какие химические изменения могут произойти с изделием из полиметилметакрилата при длительном нахождении его в кислой среде?
2. В процессе изготовления полимерной пломбы в зубе врач предложил пациенту надеть

на глаза светозащитные очки. Какой способ полимеризации был использован? Могла ли

находиться в составе композита для изготовления пломбы перекись бензоила? Объясните

роль этой добавки. Запишите реакцию полимеризации стирола с участием перекиси

бензоила.


  1. В медицине долгое время применяли 6% водно-солевой раствор

поливинилпирролидона с низкой степенью полимеризации ( М 12 000 – 27 000 ) для детоксикации организма при отравлениях, инфекционных заболеваниях.

-Запишите формулу мономера N – винил -2-оксопиррола (N- винилпирролидона) и схему реакции полимеризации.
- Рассчитайте молекулярную массу мономера и определите степени полимеризации полимера по граничным величинам выше указанной молекулярной массы.

- Как вы думаете, может ли этот мономер или полимер образовать соль в кислой среде ?
4. Какая основная причина старения полимерных изделий из природного каучука? полистирола, полученного блочной полимеризацией?
5. В промышленности карбоксиэтилцеллюлозу получают взаимодействием целлюлозы с хлоруксусной кислотой. Запишите реакцию полной этерификации на примере фрагмента целлюлозы ( из двух остатков глюкозы). Какой образуется эфир: простой или сложный? Какой механизм этой реакции?

ПРИЛОЖЕНИЕ

ИСТОРИЧЕСКИЕ ДАТЫ ЗНАМЕНАТЕЛЬНЫХ ОТКРЫТИЙ В

БИООРГАНИЧЕСКОЙ ХИМИИ

( Х1Х и первая половина ХХ вв)


дата

Историческое событие

1811

К.С. Кирхгоф получил виноградный сахар( глюкозу) из крахмала

1815

Ж. Био установил существование 2лево» и « право»- вращающих растворов веществ







1815

Ф. Штромейер открыл качественную реакцию на крахмал с йодом

1820

Велер синтезировал щавелевую кислоту из неорганического соединения дициана

1860

Л. Пастер обобщил результаты исследований оптически активных веществ

1861

А.М. Бутлеров сформулировал теорию строения органических соединений

861

Й. Лошмидт предложил структурные графические формулы

1861

А.М. Бутлеров объяснил явление изомерии на основе теории строения органических соединений

1862

Э. Эрленмейер высказал идею о существовании двойной связи в этене, тройной в ацетилене

1864

А. Крум-Браун ввел изображение химических связей черточками

1865

Д.И.Менделеев заложил основу понятия « водородная связь». Изучая взаимодействие в системе « спирт- вода».

1862 - 1865

А. Кекуле предложил классификацию: « насыщенные»,

« ненасыщенные» « ароматические» соединения».

1866

М. Бертло осуществил синтез бензола тримеризацией ацетилена

1868

Г. Вихельхауз ввел понятие « валентность».

1868

К. Шерлеммер заключил, что все 4 валентности у углерода в метане равноценны

1869

В.В. Марковников развил представления о взаимодействии атомов в молекулах, сформировал правила о направлениях реакций присоединения, отщепления

1869

А. Ладенбург доказал равноценность всех атомов водорода в бензоле

1870

Ю. Либих предложил теорию действия ферментов

1870

Н. И. Любавин выдвинул теорию об аминокислотном строении белковэтене, тройной в ацетиленех, сформировал направление

1872

А. Кекуле изобразил молекулу бензола с тремя двойными связями.

1874

Я. Вант-Гофф и А. Ле Бель развили теорию о тетраэдрическом строении атома углерода в метане

1874

Я. Вант-Гофф сформулировал основные принципы кинетики химических реакций

1885

К. Лаар ввел понятие « таутомерия»

1886-7

В. Оствальд разработал теорию « кислотно- основного катализа»

1888

К. Оверс и В. Мейер предложили термин « стереохимия»

1889

С. Аррениус ввел понятие «энергия активация»

1890

Н.А. Меншуткин доказал влияние растворителя на скорость протекающей в нем химической реакции

1890

Э. Фишер разработал номенклатуру, классификацию и рациональные формулы углеводов



1892

На международном съезде в Женеве приняли номенклатуру органических соединений( женевская номенклатура)

1897

Дж. Томсон и независимо Э. Вихорт открыли электрон

1908

У. Рамзай высказал идею. Что электрон осуществляет связь между атомамиэтене, тройной в ацетиленех, сформировал направление

1908

И. Штарк выдвинул теорию химических связей в органических соединениях

1911

Г. Фрай предложил электронные формулы органических соединений

1913

М. боденштейн заложил основы теории цепных процессов

1915

И. Штарк ввел понятие « валентные электроны»

1916

Г. Льюис развил идею ковалентной химической связи

1920

Р. Герцог, В. Янке, М. Поляни впервые определили структуру органического вещества- целлюлозы- методом рентгеноструктурного анализа

1922

Р. Робинсон высказал идею об « электромерном» ( индуктивном) и

« мезомерном» механизмах смещения электронной плотности в органических молекулах

1922-3

И. Бренстед и Г. Льюис развили теорию кислот и оснований в приложении к органическим соединениям

1931

Э. Хюккель заложл основы квантовой химии органических соединений

1931

Ф. Хунд ввел понятия о σ - , π – связях в органических молекулах

1931

Э. Хюккель сформулировал правило ( 4п+ 2 ) для ароматических соединений

1932

Р. Малликен ввел понятие « молекулярная орбиталь».

1932

Л. Полинг предложил понятие «электроотрицательность» и шкалу э.о.

1933

Ч. Ингольд сформулировал принципы теории электронных смещений

1939

Р. Малликен ввел термин « сверхсопряжение» ( гиперконъюгация)

1941

И. Сваргольм предложил « молекулярные диаграммы» органических соединений - структурные формулы, в которых над атомами записаны знаки частичных зарядов

1947

Г. Шварценбах предложил метод определения енолов в кето-енольной смеси изомеров.

1951

Л. Полинг и Р Кори открыли вторичную структуру белка

1953

Ф. Крик и Дж. Уотсон открыли структуру ДНК- двойную спираль

2. СТРУКТУРНЫЕ ФОРМУЛЫ БИООРГАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ

( по темам лекций)

Примечание: нижеприведенные структурные формулы биоактивных соединений не всегда отражают их истинное пространственное строение

СОПРЯЖЕННЫЕ СОЕДИНЕНИЯ

Сопряженные линейные соединения



Бутадиен-1,3




2-Метилбутадиен-1,3 (изопрен)



Хлорвинил



Винилацетат


Карбоциклические ароматические соединения



Бензол




Нафталин



Фенантрен




Антрацен



Анилин



Фенол



Бензойная кислота




Салициловая кислота



4-аминобензойная кислота




4-аминофенол



n-сульфаниловая кислота







Хинон



Гидрохинон



Гетероциклические ароматические соединения



Фуран




Тиофен



Пиррол




Имидазол




Пиридин




Пиримидин



Пурин




Индол



Никотиновая кислота



Никотинамид


Карбоновые кислоты (указаны тривиальные названия)
Монокарбоновые кислоты



Насыщенные кислоты

Ненасыщенные кислоты



Муравьиная кислота




Акриловая кислота




Уксусная кислота



Кротоновая кислота



Пропионовая кислота




Метакриловая кислота



Масляная кислота




Пальмитиновая кислота




Валериановая кислота




Стеариновая кислота




АцетилКоА






Дикарбоновые кислоты




Щавелевая кислота



Малоновая кислота




Янтарная кислота




Глутаровая кислота



Малеиновая кислота (цис)




Фумаровая кислота (транс)


Гидроксикислоты




Гликолевая кислота




Молочная кислота



Яблочная кислота

(Малат)




3-гидроксимасляная кислота



Лимонная кислота

(Цитрат)



Изолимонная кислота

(Изоцитрат)



Оксокислоты (надо знать в двух таутомерных формах-енольной и кетоновой)




Пировиноградная кислота

(ПВК)




Фосфоенолпируват

(ФЕП)



Щавелевоуксусная кислота

(ЩУК)




α -Кетоглутаровая кислота

(α -КГ)



β-оксомасляная кислота

(Ацетоуксусная кислота)






ЛИПИДЫ


Ненасыщенные жирные кислоты



Олеиновая кислота (цис)

(18 : 1 : 9)




Линолевая кислота. Обозначения: (18:2: 9, 12), ∆9,12 ω 6



ω 6 ∆ 9



Линоленовая кислота

(18 : 3 : 9:12:15); ω-3






Арахидоновая кислота

(20 : 4 : 5:8:11:14) ω-6



Простые липиды



Воск

(R1 – высший спирт,

R2 – жирная кислота)



L –Триглицерид


Сложные липиды



L –Фосфатидовая кислота

(фосфатидная кислота)




L –Фосфатидилхолин

(Лецитин)



L –Фосфатидилэтаноламин

(Кефалин)




L -Фосфатидилсерин

Стероиды



Холестерин



Циклопентанопергидрофенантрен – лежит в основе стероидных соединений

L-Аминокислоты ОРГАНИЗМА

Незаменимые аминокислоты обозначены звездочкой -*



Общая формула α-L-аминокислот

в проекции Фишера



Алифатические аминокислоты



Глицин




Аланин



Валин*




Лейцин*



Изолейцин*





Кислые аминокислоты



Аспарагиновая кислота



Глутаминовая кислота


Основные аминокислоты



Аргинин



Лизин*



Орнитин






Аминокислоты, содержащие амидную группу



Глутамин




Аспарагин

Серусодержащие аминокислоты



Цистеин




Метионин*

Гидроксиаминокислоты



Серин




Треонин*

Карбоциклические ароматические аминокислоты



Фенилаланин*




Тирозин

Гетероциклические ароматические аминокислоты

Триптофан*



Гистидин


Циклические аминокислоты




Пролин



4-гидроксипролин



Углеводы и их производные

Моносахариды: надо знать в линейных и аномерных циклических формах и их производные – многоатомные спирты, оновые, уроновые, аровые кислоты. Понятия: аномеры, эпимеры, диастереомеры, D- , L-ряды.



D-Рибоза




2-дезокси-D-рибоза



D-Ксилоза




D-Ксилулоза



D-Глюкоза β-D-Глюкопираноза






α-D-Глюкопираноза




D –Манноза




D -Фруктоза β-D-фруктофураноза



D-Галактоза α-D-Галактопираноза





α-пиранозная форма

D-глюкуроновой кислоты



D-Сорбит



D-Маннит


Дисахариды



Мальтоза

(связь α-1, 4)




α-Лактоза

(связь α-1, 4)




β-Лактоза

(связь β-1, 4)




β-Целлобиоза

(связь β-1, 4)




Сахароза

(связь α-1, 2)


Полисахариды (гомополисахариды, гетерополисахариды)



Фрагмент амилозы

(связь α-1, 4)



Фрагмент амилопектина

(Основная связь α-1, 4, ветвление α-1, 6 через 20-25 остатков глюкозы)

Крахмал (состоит из амилозы и амилопектина)




Гликоген

(Основная связь α-1, 4, ветвление α-1, 6 через 8-12 остатков глюкозы)




Целлюлоза

(связь β-1, 4)



Декстран

(указана только основная связь α-1, 6)




биозный фрагмент гиалуроновой кислоты

1. D-глюкуроновая кислота (β-1, 3)

2. N-ацетил-D-глюкозамин (β-1, 4)




биозный фрагмент хондроитин-6-сульфата

1. D-глюкуроновая кислота (β-1, 3)

2. N-ацетил-D-галактозамин-6-сульфат (β-1, 4)




биозный фрагмент гепарина

1. D-глюкуроновая кислота (α-1, 4)

2. N-ацетил-D-глюкозозамин- 6-сульфат (β-1, 4)




Азотистые основания и их производные

Нуклеиновые основания



Тимин

(5-метил-2,4-диоксопиримидин)




Цитозин

(4-амино-2-оксопиримидин)



Урацил

(2,4-диоксопиримидин)




Оротовая кислота



Аденин

(6-аминопурин)




Гуанин

(2-амино-6-оксопурин)



Гипоксантин

(6-оксопурин)




Ксантин

(2,6-диоксопурин)



Мочевая кислота

(2,6,8-триоксопурин)



Мочевая кислота

(2,8-дигидрокси, 6-оксопурин)

Солеобразующая форма


Нуклеозиды (Рибонуклеозиды)

Производные пиримидина

Окончание: иДИн

Производные пурина

Окончание: озин



Уридин




Аденозин



Цитидин




Гуанозин



Тимидинрибозид

Риботимидин



Инозин

Минорный нуклеозид


Нуклеозиды (Дезоксирибонуклеозиды) Приставка: ДЕЗОКСИ

Производные пиримидина

Окончание: иДИн

Производные пурина

Окончание: озин



Тимидин




2’-Дезоксиаденозин



2’-Дезоксицитидин




2’-Дезоксигуанозин


Нуклеотиды – составные компоненты РНК (Рибонуклеотиды)

Окончание: ИЛОВАЯ КИСЛОТА

Окончание: ИЛОВАЯ КИСЛОТА



УМФ

Уридинмонофосфат

Уридин-5’-ф

Уридиловая кислота



АМФ

Аденозинмонофосфат

Аденозин-5’-ф

Адениловая кислота



ЦМФ

Цитидинмонофосфат

Цитидин-5’-ф

Цитидиловая кислота




ГМФ

Гуанозинмонофосфат

Гуанозин -5’-ф

Гуаниловая кислота

Важные нуклеотиды и динуклеотиды



АТФ

Аденозинтрифосфат




НАД+

Никотинамидадениндинуклеотид



НАДФ·H

Никотинамидадениндинуклеотид фосфат




ц-3’, 5’-АМФ

цАМФ




ц-3’,5’-ГМФ

цГМФ



УДФ-глюкуроновая кислота




ФАФС

3’-Фосфоаденозил-5’-фосфосульфат


Лекарственные препараты



Аспирин

(Ацетилсалициловая кислота)







Сульфаниламидный препарат




Белый стрептоцид



Парацетамол




Фенацетин




Анестезин




Новокаин



Барбитуровая кислота

(2,4,6-триоксопиримидин)




Барбитал (Веронал)

(5,5-диэтилбарбитуровая кислота)



Фенобарбитал (люминал)

(5-этил-5-фенилбарбитуровая кислота)







Кофеин

(1,3,7-триметилксантин)




Теофиллин

(1,3-диметилксантин)



Теобромин

(3,7-диметилксантин)





Витамины



Ретинол




Ретиналь




Аскорбиновая кислота

(аскорбат)



Дегидроаскорбиновая кислота

(дегидроаскорбат)


Гормоны, нейромедиаторы и другие биологически активные молекулы



Адреналин



Норадреналин




Ацетилхолин



Триптамин




Гистамин




Серотонин



γ-Гидроксимасляная кислота

ГОМК




γ-Аминомасляная кислота

ГАМК



Аминоэтанол



Холин


Биоактивные вещества



Мочевина



Биурет



Глицерин




Этиленгликоль


СНI3

Йодоформ



Ацетон



Никотин






ВОПРОСЫ ДЛЯ САМОПОДГОТОВКИ

К ЗАЧЕТУ И ЭКЗАМЕНУ
1. Теоретические положения строения и свойств биоорганических

соединений


1

Предмет и задачи биоорганической химии. Роль биоорганической химии в подготовке врача.

2

Изомерия органических соединений. Определение понятия. Классификация.

3

Пространственная (стереоизомерия) на примере моносахаридов и аминокислот. Определение понятия энантиомеры, диастереомеры, рацемат. Биологическое значение стереоизомерии в биологических системах.

4

Лактам-лактимная и кето-енольная таутомерия. Определение понятия. Значение таутомерных форм в биосистемах (примеры).

5

Сопряженные системы с открытой цепью сопряжения. Характеристика. Виды сопряжения. Энергия сопряжения. Классификация сопряженных систем.

Сопряженные системы с открытой цепью сопряжения (бутадиен-1,3, изопрен, каротин, ретинол, ретиналь, хлорэтен, кротоновая кислота). Биологическое значение.

Карбоциклические ароматические системы (бензол, нафталин, антрацен, фенантрен). Правило Хюккеля, критерии ароматичности.

6

Гетероциклические сопряженные системы (пяти- и шестичленные). Участие атома азота в образовании гетероциклических ароматических систем, тип гибридизации - пиррольный и пиридиновый атомы азота. Строение пиррола тиофена, фурана, пиридина, пиримидина, пурина, биологическая роль пяти- и шестичленных гетероциклических соединений.

7

Индуктивный и мезомерный эффекты. Определение. Понятие об электронодонорных и электроноакцепторных заместителях.

8

Теория Бренстеда-Лоури. Кислотность органических соединений и определяющие ее факторы. Основные классы биоорганических веществ, обладающие кислотными свойствами. Значение кислотно-основных свойств у биоорганических соединений.

9

Основность органических соединений и факторы, ее определяющие. Сравнительная характеристика изменения основных свойств у аминов (алифатические первичные, вторичные, ароматические, амиды). Образование солей с неорганическими кислотами, образование четвертичных аммониевых солей (на примере N-метилпиридинийхлорида и холина).

10

Типы разрыва химической связи и типы реагентов. Классификация механизмов реакции в биоорганической химии.

11

Радикалы. Определение понятия Активные формы кислорода.. Свободно-радикальное окисление жирных кислот и его роль в патологии клетки Механизм реакции радикального замещения в ряду алканов.

12

Механизмы реакции электрофильного присоединения (AE)- реакции гидратации, гидрогалогенирования, дигалогенированияв ряду алкенов. Влияние электронодонорных и электроноакцепторных заместителей на направленность реакции AE в алкенах. Значение реакции гидратации в биохимических процессах.

Механизм реакции электрофильного замещения в ароматических соединениях (бензол и его замещенные)

13

Механизм реакций нуклеофильного присоединения к карбонильных соединений (ANU). Нуклеофильные реагенты - вода, спирты, циановодород, тиолы, амины. Электронное строение карбонильной группы. Биологически важные реакции нуклеофильного присоединения в клетке (образование полуацеталей, тиополуацеталей, азометинов).

14

Реакции нуклеофильного замещения и элиминирования. Конкурентный характер процессов. Условия реакций дегидратации и дегидрогалогенирования. Значение реакций дегидратации в биохимических процессах

.Механизм реакции нуклеофильного присоединения-отщепления в ряду карбоновых кислот. Образование производных карбоновых кислот и их биологическое значение (сложные эфиры, амиды, ангидриды, тиоэфиры - активные формы карбоновых кислот в клетке) АцетилКоА.

15

Окисление спиртов, тиоспиртов и альдегидов. Особенности окисления –SH и –ОН групп. Значение SH групп в биологических системах.

16

Строение и механизм работы НАД+. Участие НАД+ в окислительно-восстановительных реакциях.
1   ...   18   19   20   21   22   23   24   25   26


написать администратору сайта