Главная страница
Навигация по странице:

  • Таблица 12.1. Основные пометы промотора, общие для разных генов

  • ГГАЦААТТГ(-85) ТАТАААА(-34)

  • ГАЦЦААТЦА ( - 75) ΤΑΤΑΛΑΤ ( - 30)

  • ЦГТЦАААТГ ТАТААГТ Глобин

  • АГЦЦААТГА(-88) ЦАТАТАА(-29)

  • ГЦЦЦАТТГЦ(-78) ТАТАААТ Инсулин

  • ГГЦЦАГТЦГ(-73) ТАТАААГ(-29)

  • ГГТЦАААЦТ(-74) ГАГАГАТ(-31)

  • ГТАЦАААТА (–93) ТАТАААА (-29)

  • Гилберт С. Биология развития. Т.2.doc ,БИР. Библиография Гилберт С. Биология развития в 3х т. Т. 2 Пер с англ. М. Мир, 1994. 235 с


    Скачать 19.05 Mb.
    НазваниеБиблиография Гилберт С. Биология развития в 3х т. Т. 2 Пер с англ. М. Мир, 1994. 235 с
    АнкорГилберт С. Биология развития. Т.2.doc ,БИР.doc
    Дата19.03.2017
    Размер19.05 Mb.
    Формат файлаdoc
    Имя файлаГилберт С. Биология развития. Т.2.doc ,БИР.doc
    ТипДокументы
    #3951
    страница38 из 74
    1   ...   34   35   36   37   38   39   40   41   ...   74

    Гилберт С. Биология развития: В 3-х т. Т. 2: Пер. с англ. – М.: Мир, 1994. – 235 с.


    142_______________ ГЛАВА 12_____________________________________________________________________________




    Рис. 12.5. Схема дифференциальной регуляции гена у E. coli; показаны цис- и транс-регуляторные элементы. В клетках дикого типа индуцибельное состояние характеризуется тем, что РНК для β-галактозидазы не транскрибируется, пока отсутствует лактоза. В отсутствие лактозы белок-репрессор (R) кодируемый геном i, присоединяется к сайту оператора (о), ингибируя этим транскрипцию РНК-полимеразой с промотора (p). Если лактоза присутствует, то она связывается с белком-репрессором, в результате репрессор не может присоединиться к ДНК и транскрипция продолжается. Растворимая природа этого репрессора показана в опытах на мутантах E. Coli. Когда гаплоидные бактериальные клетки, несущие ген i , становятся частично диплоидными с геном i дикого типа (i+ ), синтезируется репрессор дикого типа, который способен сделать индуцибельным исходный ген ß-галактозидазы. Этот белок-репрессор является транс-регуляторным элементом. Последовательности промотора и оператора представляют собой цис-регуляторные элементы.



    Рис. 12.6. Типичный промотор для гена эукариот, кодирующего белок. Представленный ген содержит ТАТА-бокс и три 5'-элемента промотора. Примеры таких 5’-элементов представлены в нижней части рисунка. (По Maniatis et al., 1987.)


    транскрипция, и длина их составляет приблизительно 100 пар оснований. Участок промотора необходим для присоединения РНК-полимеразы II и точной инициации транскрипции. Энхансер активирует утилизацию промотора, контролируя эффективность и скорость транскрипции с этого конкретного промотора. Энхансеры активируют только лежащие в цис-положении промоторы (т.е. промоторы на той же самой хромосоме), но они могут функционировать и на больших расстояниях. Кроме того, они могут находиться не только на 5'-стороне гена, но и на другой цепи ДНК (Maniatis et al., 1987).

    Промоторы генов, которые транскрибируют относительно большие количества мРНК, имеют сходную структуру. В них содержится последовательность АΤΑ (называемая иногда ТАТА-боксом или боксом Голдберга–Хогнесса), располагающаяся на расстоянии приблизительно 30 пар оснований с 5'-стороны от сайта, где начинается транскрипция, и один или несколько передних элементов промотора, лежащих еще дальше с 5'-стороны. Передний элемент промотора обычно представляет собой вариацию последовательности ЦААТ, но выявлены и другие промоторные элементы (Grosschedl, Birnstiel, 1980; McKnight, Tjian, 1986) (рис. 12.6).

    Впервые промотор β-глобинового гена исследовали в опытах по проверке специфической транскрипции клонированной ДНК. Клонированные гены могут транскрибироваться правильно, когда они введены в ядра ооцитов лягушки или фибробластов или когда они инкубируются с очищенной РНК-полимеразой в присутствии нуклеотидов надосадочной жидкости (Wasylyk et al., 1980). После того как транскрипция гена подтверждена, для получения специфических делений в этом гене или окружающих его участках используют рестриктазы. Затем можно выяснить, продолжает ли правильно транскрибироваться такой модифицированный ген. Результаты этих исследований показали, что для максимальной транскрипции ß-глобинового гена достаточно первых 109 пар оснований, предшествующих кэп-сайту (Grosveld et al., 1982; Dierks et al., 1983).

    Другие исследователи уточнили этот вывод с помощью клонирования участка глобинового гена мыши от 106-й пары оснований выше (с 5'-стороны) старта транскрипции (положение —106) вплоть до 475-й пары оснований (положение +475) в первом экзоне (Myers et al., 1986). Эти клоны были подвергнуты мутагенезу in vitro. Таким способом в область промотора глобинового гена было введено

    Гилберт С. Биология развития: В 3-х т. Т. 2: Пер. с англ. – М.: Мир, 1994. – 235 с.


    МЕХАНИЗМЫ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНОЙ ТРАНСКРИПЦИИ ГЕНОВ 143



    Рис. 12.7. Влияние отдельных точковых мутаций в промоторе ß-глобинового гена мыши на способность промотора к инициации транскрипции. Каждая линия представляет уровень транскрипции с мутантного промотора по отношению к уровню транскрипции с глобинового промотора дикого типа, определяемому в параллельных опытах. Черными точками указаны нуклеотиды, для которых не были получены мутации. Под гистограммой представлена схема, показывающая положение ТАТА-бокса и двух 5'-элементов промотора в гене ß-цепи глобина мыши. (Из Maniatis et al., 1986.)


    130 различных одиночных замен оснований. Полученные клонированные гены вводили в плазмиды, содержащие энхансер, и затем с помощью трансфекции – в культивируемые клетки, которые в обычных условиях не синтезируют глобин. Будут ли в таких клетках транскрибироваться усеченные глобиновые мРНК (475 оснований) с этих клонов? Результаты опытов показаны на рис. 12.7. В большинстве случаев мутации в 5'-фланкирующей области не влияли на эффективность транскрипции глобинового гена. Однако мутации в трех кластерах нуклеотидов резко снижали транскрипцию. Один кластер находился в ТАТА-боксе (боксе Голдберга–Хогнесса), другой – в переднем ЦАAT-элементе промотора, а третий – в участке ГЦЦАЦАЦЦЦ, от 95-й до 87-й пары оснований выше кэп-сайта.


    Таблица 12.1. Основные пометы промотора, общие

    для разных генов

    Ген

    ЦААТ –участок1)

    ТАТА-участок1)

    Гистон







    Н2A (морской еж)

    ГГАЦААТТГ(-85)

    ТАТАААА(-34)

    Н2В (морской еж)

    ГАЦЦААТГА ( -92)

    ТАТАААА(-26)

    Н3 (морской еж)

    ГАЦЦААТЦА ( - 75)

    ΤΑΤΑΛΑΤ ( - 30)

    Н2А (дрозофила)

    АГТЦААТТС

    ТАТАААТ

    Н3 (дрозофила)

    ЦГТЦАААТГ

    ТАТААГТ

    Глобин







    α (мышь)

    АГЦЦААТГА(-88)

    ЦАТАТАА(-29)

    α2 (человек)

    АГЦЦААТГА (-70)

    ЦАТАААЩ-28)

    Коллаген







    α2 тип I (курица)

    ГЦЦЦАТТГЦ(-78)

    ТАТАААТ

    Инсулин







    Человек

    ГГЦЦАГТЦГ(-73)

    ТАТАААГ(-29)

    Крыса 1

    ГТЦЦАААЦГ(-78)

    ТАТАААГ(-3О)

    Овальбумин

    ГГТЦАААЦТ(-74)

    ГАГАГАТ(-31)

    Кональбумин

    ГГАЦАААЦА(-81)

    ΤΑΤΛΑΑΑ ( - 30)

    Фибрион шелка

    ГТАЦАААТА (–93)

    ТАТАААА (-29)

    Источник: Efstratiadis et al., (1980); Vogeli et al., (1981)

    1) Числа в скобках указывают положение в 5’-области от точки, где инициируется транскрипция.



    1   ...   34   35   36   37   38   39   40   41   ...   74


    написать администратору сайта