Государственный научноисследовательский центр профилактической медицины основы доказательной
 Скачать 1.39 Mb.
|
|
ГЛАВА 2. Как правильно сформулировать клинический вопрос? Поскольку в базу данных Best Evidence включаются только исследования вы- сокого методического уровня (например, РКИ, в которых до конца исследования наблюдалось не менее 80% участников), ее объем значительно меньше, чем у дру- гих аналогичных источников информации. С другой стороны, эта база не охваты- вает весь диапазон имеющихся данных. Поэтому если ограничиться только Best Evidence поиск не будет полным. Cochrane Library (Кокрановская библиотека) Кокрановское сотрудничество (Cochrane Collaboration) представляет собой международную организацию, задачами которой – подготовка, проведение и рас- пространение систематических обзоров, посвященных оценке эффективности и безопасности различных медицинских вмешательств. Важной задачей также является создание электронной базы данных, позволяющих осуществлять быст- рый поиск необходимой информации. Эта база (Cochrane Library) включает в себя главным образом систематические обзоры РКИ, посвященные оценке различных аспектов лечения. Cochrane Library публикуется на компакт-дисках и в Интернете, обновляется ежеквартально и состоит из нескольких частей. Во-первых, это Кокрановский регистр контролируемых исследований (Cochrane Control Trials Registry – CCTR), содержащий постоянно пополняющийся перечень клинических исследований. Эти исследования выявляются членами Кокрановского сотрудничества в различ- ных источниках, в том числе в других электронных базах данных, посредством ручного поиска и изучения библиографических списков в оригинальных статьях и обзорах. Второй раздел – это база данных Кокрановских систематических обзоров (Cochrane Database of Systematic Reviews – CDSR). Она содержит исчерпываю- щую информацию обо всех систематических обзорах, подготовленных членами Кокрановского сотрудничества. В ней можно также найти информацию о протоко- лах незавершенных обзоров. Кроме того, в Cochrane Library имеется база данных, посвященная научному синтезу, принципам и методологии проведения систематических обзоров. UpToDate UpToDate представляет собой обширную учебную базу данных, обновляемую каждые 4 месяца. Она существует только в электронном виде. В отличие от Best Evidence и Cochrane Library, при подготовке этой базы данных строгие методологи- ческие критерии отбора не применяются. В тоже время UpToDate содержит много высококачественных исследований, отобранных составителями разделов. Clinical Evidence База данных Clinical Evidence выпускается издательской группой BMJ и одним из американских медицинских обществ American College of Physicians – American Society of Internal Medicine. Эта база построена по тому же принципу, что и UpToDate. Однако при ее составлении мнение экспертов учитывается в меньшей степени. Эта база – не учебное пособие, а краткий анализ самых современных знаний о профилактике и лечении наиболее распространенных и клинически значимых за- болеваний и состояний. 34 ОСНОВЫ ДОКАЗАТЕЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ 2.4.5. Медицинские электронные базы данных, в которые включаются материалы, не использующие критерии методологического качества. MEDLINE MEDLINE является одной из наиболее известных тематических зарубеж- ных реферативно-библиографических баз данных. Эта база данных создана и поддерживается Национальной Медицинской библиотекой США. MEDLINE содержит библиографические описания и рефераты статей по медицине, хирургии, стоматологии, уходу за больными и организации здравоохране- ния, опубликованных в биомедицинских журналах, издающихся в 71 стране мира. База данных MEDLINE обновляется еженедельно. В настоящее время она содержит более 11 миллионов описаний статей из 4500 журналов, при- мерно 76% описаний включают рефераты (abstracts). Эту базу данных дополняет раздел PreMEDLINE, который содержит ин- формацию о недавно опубликованных отчетах, еще не прошедших про- цедуру индексирования. Библиографические описания, принадлежащие PreMEDLINE, имеют специальную пометку [PubMed – in process]. После прохождения индексирования документы из PreMEDLINE перемещаются в MEDLINE. К достоинствам MEDLINE следует отнести почти полный обхват всех ме- дицинских журналов, а также ее доступность. MEDLINE доступна бесплатно для поиска через Интернет, как для специалистов, так и для широкой публи- ки. Работа с информационным массивом базы данных осуществляется с по- мощью поисковых систем PubMed или Internet Grateful Med. Поисковая сис- тема PubMed функционирует на одном сервере с самой базой данных, что существенно повышает скорость обработки запросов по сравнению с аль- тернативными поисковыми системами, расположенными на других серве- рах. Она позволяет осуществлять поиск не только в базе данных MEDLINE, но и в других электронных базах данных (AIDSL, OLDMEDLINE, CANCER, BIOETHICS и др.). Подробное описание MEDLINE на английском языке мож- но найти в информационном листке NLM по адресу: http://www.nlm.nih.gov/ pubs/factsheets/medline.html. При отсутствии необходимых навыков работы с MEDLINE можно посетить учебный сайт в Интернете www.docnet.org.uk/ drfelix/medtut.html. К недостаткам этой базы данных следует отнести, прежде всего, ее ог- ромные размеры и неоднородность размещенных в ней материалов. Для того, чтобы эффективно искать информацию в системе MEDLINE не- обходимо разбираться в ее структуре, процедуре индексации статей, знать язык запросов соответствующей поисковой системы (например, PubMed). Необходимо уметь пользоваться указателем медицинских предметных руб- рик (МеSН) с разворачиванием списка, выбирать термины для поиска в тек- сте рефератов и логические операторы «AND» («и») и «OR» («или»); для объединения результатов поиска по нескольким запросам. 35 ГЛАВА 2. Как правильно сформулировать клинический вопрос? Главный поисковый экран PubMed Слева на голубом вертикальном поле (sidebar) находятся ссылки на раз- личную информацию, вспомогательные средства и ресурсы PubMed: About Entrez – информация о системе Entrez, частью которой является PubMed. Entrez PubMed – под этим заголовком помещены важные ссылки на ис- точники различной справочной информации по PubMed: Overview – общее описание PubMed; Help/FAQ (Frequently Asked Questions) – помощь по PubMed и часто задава- емые вопросы (подробное описание всех элементов и средств поиска); Tutorial – интерактивное руководство по пользованию PubMed (доступ к нему можно также получить, "кликнув" мышкой на ссылке Tutorial внизу экрана); New/Noteworthy – сведения о дополнениях и изменениях, произведенных в PubMed за последнее время. PubMed Services – поисковые средства PubMed (Journal Browser, MeSH Browser, Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Link Out). Related Resources – прочие ресурсы, связанные с PubMed. Стратегия поиска в РubMed Поиск по ключевым словам (терминам) PubMed позволяет производить поиск по ключевым словам/терминам, вы- ражающим основное смысловое содержание информационного запроса. Для 36 ОСНОВЫ ДОКАЗАТЕЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ того чтобы провести простейший поиск, в поисковое окошко вносится термин, например osteoporosis, затем следует кликнуть мышкой на Go или нажать Enter наклавиатуре компьютера. Чтобы стереть термин в поисковом окошке, кликните на Clear (стереть). Как осуществляется поиск? Термин, введённый в запрос, PubMed автоматически проверяет на нали- чие его в базе данных с помощью специальных указателей. Если термину найдено соответствие в одном или нескольких указателях, выбираются все документы, включающие данный термин. Указатели проверяются в следующем порядке: • указатель медицинских предметных рубрик (MeSH Translation Table); • указатель журналов (Journals Table); • указатель фраз (Phrase List); • авторский указатель (Author Index). Поиск можно проводить и с использование функции "tехt word». В этом случае пользователь вводит определенное слово, которое затем будет най- дено в заглавии и тексте всех имеющихся рефератов. Указатель медицинских предметных рубрик (MeSH Translation Table) Данный указатель проверяется в первую очередь с целью нахождения предметной рубрики (MeSH Term), эквивалентной заданному поисковому тер- мину. Если такая рубрика находится, РubMed отбирает все документы, вклю- чающие эту предметную рубрику. Например, при поиске по термину anorexia, PubMed отберет статьи, в заглавии и/или реферате которых встречается это слово, а также статьи, включающие предметную рубрику – MeSH термин, эк- вивалентный слову anorexia. Для осуществления предварительного показа результатов поиска нужно кликнуть на Preview/Index, в этом случае можно увидеть, сколько докумен- тов было найдено по вашему запросу и, если это число слишком велико или мало, сразу же можно изменить стратегию поиска. Окошко, расположенное внизу экрана Preview/Index, позволяет добавлять новые термины к запросу, используя логические операторы. При этом можно указать поле документа, в котором есть желание вести поиск, например заглавие статьи, название журнала, и т. д. Если поисковый термин не был найден в двух предыдущих указателях, РubMеd производит поиск в указателе фраз, состоящем из сотен тысяч запи- сей, отобранных из следующих источников: указателя медицинских предметных рубрик (МеSН); унифицированной медицинской языковой системы (United Mеdiсаl Lаnguage; Sуstем – UМLS); перечня названий химических соединений (Substances). Например, фраза «left ventricular hypertrophy» будет рассмотрена как еди- ное понятие, и наличие ее будет проверяться во всех поисковых полях доку- мента – в списке предметных рубрик, в поле текста, в поле названия журнала, и т. д. В случае, если фраза не будет найдена, она будет разбита на отдельные 37 ГЛАВА 2. Как правильно сформулировать клинический вопрос? слова, и поиск будет вестись по каждому слову отдельно. При этом желательно указать, в каком поле документа следует вести поиск, например, в поле загла- вия журнала, в поле текста или каком-либо другом. Можно также использовать вспомогательные средства PubMed: МеSH браузер или журнальный браузер. Использование логических операторов Булевой алгебры Язык запросов построен относительно просто. Существует несколько основ- ных полей, слова в которых описывают содержание статьи. Для того, чтобы систе- ма могла отличить, по какому полю необходимо совершать поиск, идентификатор 38 ОСНОВЫ ДОКАЗАТЕЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ поля указывается вслед за словом или словосочетанием в квадратных скобках. Результаты поиска могут комбинироваться с учетом правил Булевой алгебры. Существуют три основных оператора, которые понимает система PubMed – опе- ратор «И» (AND), «ИЛИ» (OR) и «НЕТ» (NOT или BUTNOT). РubМеd позволяет использовать эти три логических оператора между поисковыми терминами: АND (и) используется в том случае, если два или более ключевых слова должны быть найдены в одной публикации. Например:hypertensionAND obesity (гипертония и ожирение); ОR (или) – в случае, если хотя бы одно из ключевых слов должно быть найдено. Например: hypertension ORobesity (гипертония или ожирение); NОТ (не) – в случае, если только один термин должен быть найден в доку- менте, а второй должен обязательно отсутствовать. Например: hypertension NOT obesity (гипертония, ноне ожирение). Все логические операторы должны быть напечатаны заглавными буквами. Оператор «АND» использовать не обязательно, т. к. РubMed автоматически до- бавляет его между терминами. Иногда пользователю может потребоваться исключить из найденного набора статей ссылки. Данную стратегию поиска можно представить следующим обра- зом: воспользоваться полем «тип публикации», которое в случае, если публика- ция представляет собой письмо в редакцию, будет содержать значение «Letter». Например, запросить найти все публикации, посвященные бисфосфонатам, не являющиеся письмами в редакцию. На языке запросов PubMed эта фраза будет выглядеть следующим образом: Bisphosphonate [MH] NOT Letter [PT], ана- логичное значение имеет оператор BUTNOT – Bisphosphonate [MH] BUTNOT Letter [PT]. 39 ГЛАВА 2. Как правильно сформулировать клинический вопрос? Например, необходимо найти мета-аналитические работы, посвященные влиянию симвастатина на прогноз жизни пациентов перенесших инфаркт миокарда. Как будет показано ниже, поиск работ, посвященных этой про- блеме, можно осуществить при помощи слова «Симвастатин», находящемся в поле терминов словаря MESH. Соответственно, эта часть запроса будет вы- глядеть на языке PubMed следующим образом: Simvastatin [MH]. При формулировке запроса, направленного на поиск мета-аналитических работ, также используется имеющееся в MEDLINE поле «Тип публикации» (Publication Type) Meta-analysis [PT]. Однако результаты этих двух запросов надо скомбинировать таким образом, чтобы между ними в окончательном ва- рианте присутствовали только те ссылки, которые находятся в первом и вто- ром запросах. С этой целью используем оператор AND. Схематически дан- ную стратегию можно представить следующим образом Simvastatin [MH] AND Meta-Analysis [PT]. При комбинировании запросов появляется возможность для создания за- явок практически неограниченной сложности. Сложные запросы могут ком- бинироваться друг с другом, однако следует помнить о последовательности выполнения операторов в системе PubMed. Так, первым всегда выполняется оператор NOT, затем AND и последним OR. Например, автор хотел составить запрос следующим образом: «Необходимо найти статьи по смертности в ис- следованиях симвастатина, но эти статьи не должны являться письмами в ре- дакцию или быть отозваны». Для того чтобы изменить порядок выполнения 40 ОСНОВЫ ДОКАЗАТЕЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ операторов, в языке PubMed используются круглые скобки, поскольку те опе- раторы, которые заключены внутри круглых скобок выполняются в первую очередь. Соответственно, адекватным образом описанный выше запрос на языке PubMed выглядел бы так: Simvastatin [MH] NOT (Letter [PT] OR Retracted Publication [PT]) AND Mortality [MH] На любом этапе поиска его можно расширить. Для этого предназначена команда «explode» («расширить поиск»), которая позволяет найти все ре- фераты, проиндексированные с использованием введенного термина и род- ственных ему понятий. Также на любом этапе поиска, особенно при получении слишком большого количества статей в ответ на запрос, с целью улучшения качества и результатов поиска, в РubMed предусмотрена функция «Limits» (ограничения). При выборе нужного ограничения (например, по полу, возрас- ту и т. д.) следует кликнуть на «Limits», затем кликнуть на Gо, вокошке возле этого слова появится «галочка» (∨). Другие поля MEDLINE Хотя MESH термины и являются важнейшим компонентом системы MEDLINE, в базе библиографических данных имеется ряд других полей, кото- рые являются чрезвычайно полезными для точной формулировки запроса. Поле «Имя автора» [AU]. В случае, если поисковый термин представлен фамилией и двумя инициалами, можно получить желаемый результат, при 41 ГЛАВА 2. Как правильно сформулировать клинический вопрос? условии, конечно, что статьи этого автора представлены в РubMed. Про воз- можность поиска по данному полю следует помнить, когда необходимо рас- ширить условия поиска, особенно для авторов, которые могут публиковать свои работы не только на английском языке. Использование фамилии автора сужает поиск. С 2000 года по настоящее время в MEDLINE вносятся все авто- ры, перечисленные в разделе «Авторы» соответствующей публикации. Поле «Нахождения ссылки»: наименование журнала [TA], том [VI], вы- пуск [IP] и страницы [PG]. Система PubMed хранит информацию о место- нахождении журнальной ссылки в нескольких полях. Для начала необходимо знать название журнала. Поиск журнала производится при помощи поля «Имя журнала» [TA] – куда записано сокращенное наименование журнала и его ин- декс. Однако ввести можно и полное наименование журнала. Запросы J Biol Chem [TA], Journal of Biological Chemistry [TA] или 0021-9258 [TA] дадут анало- гичные результаты. Поле «Дата публикации» [DP] Дата публикации вводится в формате ГОД/ МЕСЯЦ/ДЕНЬ, например, 3 декабря 1999 года будет выглядеть следующим образом 1999/12/03[DP]. Для указания диапазона дат используется двоето- чие, например диапазон дат с 1999 по 2002 год будет записан следующим образом – 1999:2002 [DP]. Поле «Язык» [LA] Наиболее адекватный метод работы с литературой предполагает, что, найдя ссылку и оценив интерес и основное содержание статьи, пользователь предпримет попытки нахождения полного текста этой публикации. В большинстве случаев, публикации снабжаются резюме на анг- лийском языке, поэтому исследователь может выявить публикации, имеющие резюме, используя ключевое слово «hasabstract». Структура языка запросов, несмотря на свою простоту, является довольно гибкой, но для реальной рабо- ты с ней необходимо хорошо разбираться в назначении и значениях ключе- вых полей системы PubMed. Поле «Текстовое слово» [TW]. Данное поле включает все слова и цифры, встречающиеся в заголовке, резюме статьи, MESH термины, подзаголовки, наименования химических соединений и слова в поле «Имя как тема» [PS]. Поле PS позволяет искать фамилии людей, которым посвящена работа, на- пример Nightingale F [PS]. Поиск при помощи поля «текстовое слово» являет- ся весьма чувствительным, но крайне мало специфичным и, соответственно, результатом может явиться получение выборки, состоящей из слишком боль- шого количества ссылок. Журнальный браузер (Journal Browser). Браузер позволяет находить информацию о журналах в PubMed, а также библиографические описания из этих журналов. Кликнув мышкой на надписи Journal Browser налевом поле главного поискового экрана (sidebar), вы перейдете на поисковый экран журнального браузера. Браузер позволяет вести поиск по следующим параметрам: по полному заглавию журнала; по его аббревиатуре; 42 ОСНОВЫ ДОКАЗАТЕЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ по Международному Стандартному Серийному Номеру (ISSN); по любому фрагменту заглавия. Контролируемый словарь медицинских терминов MESH [MH] Сердцем MEDLINE является контролируемый словарь медицинских терми- нов или MESH (MEdical Subject Headings), насчитывающий более 19000 тер- минов и ежегодно обновляемый. Для опытного исследователя данные MESH термины будут содержать дополнительную информацию. Таким образом, для адекватной работы с MEDLINE необходимо умение работать с ее словарем. Словарь MESH терминов построен по иерархическому принципу. Это означа- ет, что у термина могут быть подчиненные, уточняющие термины, и термины более общие. Так, например, в словаре есть общий термин «Остеопороз». Иерархическая структура этого термина приведена ниже. У основного термина (более высокого порядка) есть уточняющие термины (более низкого порядка). При использовании поисковой системы «термин» более высокого уровня автоматически раскрывается (expanded). Следует отметить, что один и тот же MESH термин может входить более чем в одну иерархическую структуру. Для работы со словарем MESH в Интернет сущес- твует специализированный раздел на сайте национальной медицинской биб- лиотеки США – MESH Browser. Поле «Тип публикации» [PT]. Учитывая, что полезность медицин- ской информации прямо пропорциональна ее достоверности и обратно |