Главная страница
Навигация по странице:

  • По потребности организма человека в аминокислотах

  • 1.1.2. Биологические функции аминокислот

  • Структурные элементы белков.

  • Структурные элементы других природных соединений.

  • Исходные соединения для образования в организмах биогенных аминов и родственных соединений.

  • Некоторые аминокислоты и биогенные амины, образующиеся из них

  • Аспарагиновая кислота

  • Глутаминовая кислота (ГАМК)

  • Нейромедиаторы и медиаторы.

  • Метаболиты

  • Ацетил-КоА

  • 1.1.3. Физико-химические свойства аминокислот

  • Физические свойства L-аминокислот

  • Кислотно-основные свойства протеиногенных аминокислот

  • 1.1.4. Химические свойства аминокислот

  • 1.1.4.1. РЕАКЦИИ С УЧАСТИЕМ КАРБОКСИЛЬНОЙ ГРУППЫ

  • Учебное пособие Часть I самара Самарский государственный технический университет 2007


    Скачать 1.81 Mb.
    НазваниеУчебное пособие Часть I самара Самарский государственный технический университет 2007
    Дата09.04.2018
    Размер1.81 Mb.
    Формат файлаdoc
    Имя файлаaminoacids.doc
    ТипУчебное пособие
    #40742
    страница2 из 10
    1   2   3   4   5   6   7   8   9   10


    По кислотно-основным свойствам аминокислоты делятся на кислые, нейтральные и основные. Нейтральные аминокислоты содержат в своей структуре одинаковое количество основных и кислотных групп. В структуре кислых аминокислот количество кислотных групп превышает количество основных, а структуре основных наоборот – количество основных групп превышает количество кислотных. Из протеиногенных аминокислот кислым характером обладают аспарагиновая и глутаминовая кислоты, основным – гистидин, аргинин и лизин, а остальные 15 аминокислот имеет кислотно-основные свойства близкие к нейтральным. Количественной интегральной мерой кислотно-основных свойств является величина pI– изоэлектрическая точка (о pI см. табл. 1.3 в п. 1.1.3).

    1-Аминоциклопропанкарбоновая кислота

    (биогенный источник этилена в растениях)
    Селеноцистеин (активный центр

    глутатионпероксидазы)




    Иботеновая кислота (яд мухомора)




    γ-Метилен-L-глутаминовая

    кислота (арахис, тюльпаны)



    Витамин U (капуста)



    Тироксин (гормон щитовидной

    железы)
    Р и с.1.2. Некоторые непротеиногенные аминокислоты
    По потребности организма человека в аминокислотах их делят на заменимые и незаменимые. 8 из 20 протеиногенных аминокислот не синтезируются в организме человека и должны поступать вместе с пищей. Эти аминокислоты называют незаменимыми (отмечены ** в табл. 1.1).

    Номенклатура природных аминокислот характеризуется широким распространением тривиальных названий. По мере открытия аминокислот, выделяемых из продуктов гидролиза различных белков, они получали название в зависимости от своих характерных свойств или происхождения белка. Например, аспарагин (от греч. аsparagos – спаржа), глицин (гликокол, от греч. glucos – сладкий). Названия, составленные по систематической номенклатуре, малоупотребительны из-за своей громоздкости. Например, триптофан по систематической номенклатуре называется α-амино-β-индолилпропионовая кислота. Но даже более короткие тривиальные названия являются слишком длинными при обозначении аминокислотной последовательности полипептидов. В связи с этим приняты международные сокращенные трехбуквенные обозначения аминокислот, а в 1968 г. комиссией IUPAC-IUB рекомендовано при написании аминокислотных последовательностей белков использовать однобуквенные обозначения аминокислот (см. табл.1.1).

    1.1.2. Биологические функции аминокислот

    В живых организмах аминокислоты выполняют ряд функций, важнейшими из которых являются следующие:

    • структурные элементы белков;

    • структурные элементы других природных соединений;

    • исходные соединения для образования в организмах биогенных аминов и родственных соединений;

    • нейромедиаторы и медиаторы;

    • метаболиты.

    Структурные элементы белков. В состав белков входят 20 протеиногенных аминокислот (см. табл. 1.1), последовательность которых кодируется генетическим кодом и которые постоянно обнаруживаются в белках. Некоторые из них подвергаются посттрансляционной модификации, т.е. могут быть фосфорилированы, ацилированы, гидроксилированы (см. рис. 1.1) и др.

    Структурные элементы других природных соединений. Изучение биосинтеза пенициллина с использованием меченых атомов показало, что в образовании молекулы этого антибиотика принимают участие аминокислоты цистеин и валин (рис. 1.3).




    Цистеин

    Р и с.1.3. Биосинтез пенициллина
    Аминокислоты и их производные входят в состав различных азотистых соединений, коферментов, антибиотиков, пептидов и др. Например, фрагмент аминокислоты β-аланина (β-Ala) входит в структуру кофермента А (КоА), а глутаминовой кислоты – в структуру тетрагидрофолевой кислоты (кофермент THF):


    β-Ala

    Кофермент А (КоА)
    Glu

    Тетрагидрофолевая кислота (кофермент THF)

    В живых организмах различных типов, и в особенности в животных, широко представлены пептиды. Среди них обнаружены соединения с разнообразными биологическими функциями (см. гл. 2 «Полипептиды»). Все пептиды, так же, как и белки, образуются из аминокислот, но в отличие от последних могут включать в себя не только протеиногенные аминокислоты, но и непротеиногенные, связанные друг с другом не только пептидными связями, но, например, сложноэфирными и др. В качестве примера приведем формулу простого линейного трипептида – глутатиона. Он присутствует во всех живых организмах и находится обычно в межклеточном пространстве в достаточно высокой концентрации:




    γ-L-Глутамил-L-цистеинил-глицин – глутатион (G-SH)
    Так как он был выделен почти 80 лет назад, его физиологические функции изучены достаточно хорошо: он защищает тиольные группы белков, инактивирует радикальные частицы, разрушает перекисные соединения, выполняет роль кофермента метилглиоксилазы.

    Исходные соединения для образования в организмах биогенных аминов и родственных соединений. Биогенные амины образуются в организме главным образом из протеиногенных аминокислот. В табл. 1.2 приведены некоторые протеиногенные аминокислоты и биогенные амины, образующиеся из них в результате реакции декарбоксилирования, а также последующих трансформаций:


    Таблица 1.2

    Некоторые аминокислоты и биогенные амины, образующиеся из них

    Аминокислоты
    и образующиеся из них биогенные амины

    Формула биогенного амина

    Функции биогенных
    аминов в организме

    Серин



    Коламин



    Холин



    Ацетилхолин



    HOCH2CH2NH2
    HOCH2CH2N(CH3)3ОН
    CH3COOCH2CH2N(CH3)3ОН



    Входит в состав кефалина
    Входит в состав лецитина
    Медиатор, нейромедиатор

    Цистеин



    Цистеамин



    HSCH2CH2NH2


    Структурный элемент

    КоА и пантетеина

    Аспарагиновая

    кислота



    β-Аланин


    H2NCH2CH2COOH


    Структурный элемент КоА

    Триптофан



    5-Окситриптофан



    Серотонин





    Медиатор, нейромедиатор

    Гистидин



    Гистамин



    Медиатор

    Тирозин



    3,4-Диоксифенил

    аланин (ДОФА)



    Дофамин



    Норадреналин



    Адреналин









    Нейромедиатор
    Медиатор, нейромедиатор

    гормон

    Медиатор, нейромедиатор

    гормон

    Треонин



    Аминопропанол



    CH3CHOHCH2NH2



    Составная часть витамина В12

    Глутаминовая

    кислота



    (ГАМК)


    H2NCH2CH2CH2COOH


    Нейромедиатор

    Аргинин



    Агматин



    Путресцин



    Спермидин



    Спермин










    Компонент рибосом

    Компонент рибосом, трупный яд
    Компонент рибосом

    Компонент рибосом

    Лизин



    Кадаверин



    H2NCH2CH2CH2CH2CH2NH2



    Компонент рибосом, трупный яд

    Нейромедиаторы и медиаторы. Термином медиатор обозначают вещества, передающие нервное возбуждение через синаптическую щель от одной клетки периферической нервной системы к соседней. Нейромедиаторыэто вещества, воздействующие на постсинаптическую мембрану синапса центральной нервной системы и вызывающие ее деполяризацию (передача нервного импульса) или, напротив, гиперполяризацию (торможение передачи нервного импульса). К нейромедиаторам относятся некоторые аминокислоты, а также пептиды, белки и биогенные амины (см. табл. 1.2).

    В связи с этим в клетках головного мозга идет активный метаболизм аминокислот. В головном мозге концентрация аминокислот, в особенности выполняющих функции нейромедиаторов, в 7-8 раз выше, чем в плазме крови. Наиболее высоким является уровень глутаминовой и аспарагиновой аминокислот (5-10 ммоль и 2-3 ммоль соответственно).

    К аминокислотам, выполняющим функции нейромедиаторов, относятся глицин, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота, ГАМК и ДОФА.

    Метаболиты. Углеродные скелеты 20 протеиногенных аминокислот превращаются в процессе метаболизма в семь различных продуктов деградации.

    1. Пировиноградная кислота – глицин, аланин, серин, цистеин, треонин,

    (пируват) триптофан, метионин.

    2. Щавелево-уксусная кислота – аспарагин, аспарагиновая кислота.

    (оксалоацетат)

    3. Фумаровая кислота – фенилаланина, тирозин.

    (фумарат)

    4. Сукцинил-КоА – изолейцин, Валин.

    5. 2-Оксоглутаровая кислота – глутаминовая кислота, глутамин,

    (2-оксоглутарат) гистидин, аргинин, пролин.

    6. Ацетил-КоА – лейцин, лизин; изолейцин.

    7. Ацетоуксусная кислота – лейцин, лизин, фенилаланин, тирозин,

    (ацетоацетат) триптофан.
    Пять метаболитов (пируват, оксалоацетат, фумарат, сукцинил-КоА, 2-оксоглутарат) являются предшественниками в процессе синтеза глюкозы (глюконеогенез). Аминокислоты, деградация которых дает один из пяти указанных выше метаболитов, называются глюкогенными аминокислотами. За исключением лейцина и лизина все остальные 18 протеиногенных аминокислот являются глюкогенными.

    Ацетил-КоА и ацетоацетат не могут включаться в глюконеогенез. Они используются организмами для синтеза жирных кислот, изопреноидов и кетоновых тел (ацетон, ацетоуксусная кислота, 3-гидроксимасляная кислота). Аминокислоты, которые образуют ацетил-КоА или ацетоацетат, называют кетогенными аминокислотами. Фактически только кетогенными являются лейцин и лизин, а такие аминокислоты, как изолейцин, фенилаланин, тирозин и триптофан, могут быть и глюкогенами и кетогенами.

    1.1.3. Физико-химические свойства аминокислот

    В кристаллическом состоянии аминокислоты находятся в виде биполярных ионов (цвиттерионов). Вследствие этого они имеют высокие температуры плавления и большинство из них растворимы в воде лучше, чем в спирте (табл.1.3).

    В водном растворе аминокислоты также присутствуют, главным образом, в виде цвиттерионов, которые находятся в равновесии с неионизированной формой, например, для глицина соотношение равновесных концентраций неионизированной и цвиттерионной форм равно 1:260000:



    Неионизированная форма Цвиттерионная форма
    Дикарбоновые аминокислоты и диаминокарбоновые кислоты существуют в водных растворах в виде смесей неионизированных и различно заряженных форм. Например, аспарагиновая кислота существует в виде следующих форм с соотношением концентраций:



    1 600 1 28 000
    В случае лизина устанавливается следующее равновесие:

    16

    320 000 1 1 800 000
    Аминокислоты гораздо лучше растворимы в водных растворах кислот и щелочей, чем в воде, что обусловлено их амфотерностью.

    В кислой среде аминокислота ведет себя как основание с константой диссоциации сопряженной кислоты Ka (α-NH2) и заряжается положительно, а в щелочной – как кислота с константой диссоциации Ka (α-COOH) и заряжается отрицательно:



    Поскольку в аминокислотах содержатся как минимум две ионогенные группы, суммарный заряд молекул зависит от pH среды. Проиллюстрируем зависимость заряда аминокислоты от рН на примере гистидина, содержащего три ионогенные группы. На рис. 1.4 приведена кривая титрования гистидина сильной кислотой и щелочью, на которой отмечаются три точки перегиба, соответствующие трем ионизирующимся группировкам (COOH, NH2, имидазольное кольцо).



    Р и с.1.4. Кривая титрования гистидина сильной кислотой и щелочью
    Таблица 1.3

    Физические свойства L-аминокислот

    L-Аминокислота

    Растворимость,

    г/100 мл, вода, 25ºС

    [α]D25,

    вода

    Тпл,

    (с разл.),ºС

    Глицин

    24,99

    -

    232-236

    Аланин

    16,54

    +1,8º

    315-316

    Серин

    5,02

    −7,5

    228

    Цистеин

    -

    −16,5

    178**

    Аспарагиновая кислота

    0,50

    +5,0

    270

    Аспарагин

    3,11

    −5,6

    233

    Фенилаланин

    2,97

    −34,5

    283

    Тирозин

    0,05

    −10,0*

    290-295

    Триптофан

    1,14

    −33,7

    293-295

    Гистидин

    4,29

    −38,5

    287-288

    Валин

    8,85

    +5,6

    315

    Треонин

    20,50

    −28,5

    253

    Метионин

    3,35

    −9,8

    280-282

    Глутаминовая кислота

    0,84

    +12,6

    247-249

    Глутамин

    3,60

    +6,3

    184

    Лейцин

    2,19

    −11,0

    293-295

    Изолейцин

    4,12

    +12,4

    285-286

    Аргинин

    Очень хорошая

    +12,5

    244

    Лизин

    Очень хорошая

    +13,5

    224

    Пролин

    162,30

    −86,2

    220-222
    * в 5M HCl; ** Тпл гидрохлорида (с разл.).
    Как видно из рис. 1.4, заряд молекулы гистидина изменяется при изменении рН от – 1 (рН >11,2) до +2 (рН < 0,2). Точка с рН 9,20 соответствует рКа α-аминогруппы, с рН 6,00 – рКа имидазольного кольца, с рН 1,77 – рКа карбоксильной группы (табл. 1.4). При рН 7,60 гистидин находится в растворе только в форме цвиттериона, и общий заряд каждой из молекул гистидина равен 0.

    Значение рН, при котором аминокислота электронейтральна, называется изоэлектрической точкой (рI). При этом значении рН (его иногда обозначают рНi ) молекула аминокислоты представляет собой биполярный ион. Если через водный раствор аминокислоты пропустить постоянный электрический ток, то при значениях рН, более низких, чем рI, аминокислота будет двигаться к катоду, при более высоких рН – к аноду, и в изоэлектрической точке не будет перемещаться. Поскольку изоэлектрические точки различных аминокислот отличаются друг от друга (см. табл.1.4), то таким путем возможно осуществить разделение смеси аминокислот. На этих особенностях поведения аминокислот в постоянном электрическом поле основан метод электрофореза.

    Как уже отмечалось выше, по величине рIможно судить о преобладании кислых или основных свойств у данной аминокислоты. Чем меньше величина рI, тем более кислыми свойствами она обладает, и наоборот, чем больше – тем более основными. Аминокислоты с величиной рIменьше 5 принято относить к кислым, больше 7 – к основным, в зоне 5-7 – к нейтральным.

    Рассмотрим возможность использования физико-химических свойств аминокислот для их идентификации и количественного анализа.

    α-Аминокислоты не имеют четких температур плавления или разложения, вследствие чего эти константы представляют ограниченную ценность для их идентификации. Это обусловлено тем, что при их нагревании происходят реакции конденсации с отщеплением воды и образованием смеси пептидов и 2,5-дикетопиперазинов:



    2,5-дикетопиперазины

    Все протеиногенные аминокислоты, за исключением глицина, оптически активны и могут быть идентифицированы по величине удельного вращения ([α]D25). Однако при этом следует иметь в виду, что величина удельного вращения и даже её знак сильно зависят от рН раствора. Например, сравните величины [α]D25 для аланина, фенилаланина и метионина, приведенные в табл. 1.3, с величинами [α]D25 для этих же аминокислот, измеренные в растворах хлористоводородной кислоты – +14,7 (1М HCl), -7,1 (5,4М HCl) и +21,2 (0,2М HCl) соответственно. В связи с этим этот метод приемлем лишь для идентификации индивидуальных аминокислот и неприемлем для анализа смесей аминокислот.

    Таблица 1.4

    Кислотно-основные свойства протеиногенных аминокислот

    L-Аминокислота

    pKa

    pI

    α-СООН

    α-NH2

    Другие группы

    Глицин

    2,34

    9,60

    -

    5,97

    Аланин

    2,34

    9,60

    -

    6,00

    Серин

    2,21

    9,15

    -

    5,68

    Цистеин

    1,71

    8,33




    5,07

    Аспарагиновая кислота

    1,88

    9,60

    3,65 (β-COOH)

    2,77

    Аспарагин

    2,02

    8,80

    -

    5,41

    Фенилаланин

    2,58

    9,24

    -

    5,91

    Тирозин

    2,20

    9,11




    5,63

    Триптофан

    2,38

    9,39

    -

    5,89

    Гистидин

    1,77

    9,20

    6,00 (имидазол)

    7,60

    Валин

    2,32

    9,69

    -

    5,96

    Треонин

    2,71

    9,62

    -

    6,16

    Метионин

    2,28

    9,21

    -

    5,74

    Глутаминовая кислота

    2,19

    9,67

    4,25 (γ-COOH)

    3,08

    Глутамин

    2,17

    9,13

    -

    5,65

    Лейцин

    2,36

    9,60

    -

    6,04

    Изолейцин

    2,32

    9,76

    -

    6,02

    Аргинин

    2,18

    9,08

    13,2 (гуанидин)

    10,76

    Лизин

    2,18

    8,95

    10,5 (ε-NH2)

    9,74

    Пролин

    1,99

    10,60

    -

    6,30
    Таким образом, для идентификации и количественного анализа аминокислот определение температуры плавления и удельного вращения позволяет получить лишь ориентировочные данные.

    Существенный прогресс в идентификации и количественном анализе сложных смесей аминокислот, образующихся при гидролизе белков, достигнут благодаря работам Мура и Стайна. Разработанный ими аминокислотный анализатор, в основе которого лежит метод ионообменной хроматографии, позволяет легко проводить качественный и количественный анализ и инструментальное детектирование этих соединений. Химической основой работы аминокислотного анализатора является реакция аминокислот с нингидрином, которая будет описана в п. 1.4.. Для идентификации аминокислот очень удобны также распределительная хроматография фенилизотиоцианатных производных аминокислот, тонкослойная хроматография и хроматография на бумаге.

    ИК-, ПМР-спектроскопия и масс-спектрометрия также могут быть использованы для идентификации индивидуальных аминокислот. Масс-спектральный анализ аминокислот ограничен их низкой летучестью, и их обычно переводят в более летучие производные (эфиры, ацетамиды и др.).

    1.1.4. Химические свойства аминокислот

    Химические свойства аминокислот определяются в первую очередь наличием в геминальном положении амино– и карбоксильной групп. Специфика бокового радикала аминокислоты (ароматические и гетероциклические циклы, дополнительные амино– и карбоксильные группы, OH– и SH-группы) определяет различия в реакционной способности при типичных превращениях, а также возможность осуществления специфических реакций. В связи с этим целесообразно химические свойства аминокислот классифицировать следующим образом: реакции с участием карбоксильной группы, с участием аминогруппы, с одновременным участием карбоксильной и аминогрупп, специфические реакции отдельных аминокислот.

    1.1.4.1. РЕАКЦИИ С УЧАСТИЕМ КАРБОКСИЛЬНОЙ ГРУППЫ
    1   2   3   4   5   6   7   8   9   10



    написать администратору сайта